RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 RRADP55042 308 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 SKP1P63208 163 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 OCA2Q04671 838 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 CDC16Q13042 620 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 DSG2Q14126 1118 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 OR4D1Q15615 310 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 NXPE4Q6UWF7 544 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 MED25Q71SY5 747 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 COX15Q7KZN9 410 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 VN1R4Q7Z5H5 301 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 TTLQ8NG68 377 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 MTBPQ96DY7 904 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 ATOH8Q96SQ7 321 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 TXLNGYQ9BZA5 131 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 IGSF5Q9NSI5 407 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 CD274Q9NZQ7 290 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 SH2B3Q9UQQ2 575 aa18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 RFPL1O75677 317 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 NSA2O95478 260 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 CYC1P08574 325 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 FBLP22087 321 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 BCL6P41182 706 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 SCTRP47872 440 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 AVPR1BP47901 424 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 REEP5Q00765 189 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 KCNAB2Q13303 367 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 BMPR2Q13873 1038 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 NKG7Q16617 165 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 HKDC1Q2TB90 917 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 TEX35Q5T0J7 233 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 ATG9BQ674R7 924 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 PLD3Q8IV08 490 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 SPATA6LQ8N4H0 392 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 TRPV3Q8NET8 790 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 UBTD2Q8WUN7 234 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 SLC13A3Q8WWT9 602 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 COL26A1Q96A83 441 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 CCDC77Q9BR77 488 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 ALG9Q9H6U8 611 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 PPCSQ9HAB8 311 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 DNAJC11Q9NVH1 559 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 C14orf105Q9NVL8 296 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 COPG2Q9UBF2 871 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 ZFP69BQ9UJL9 534 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 SLC22A7Q9Y694 548 aa18.02■□□□□ 0.48
SYF2-203ENST00000474160 URADA6NGE7 173 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 MKRN2OSH3BPM6 223 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 KLHL41O60662 606 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 HPDP32754 393 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 NFKB2Q00653 900 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 RGS1Q08116 209 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 DLG1Q12959 904 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 SLC9A5Q14940 896 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 TMPRSS11BQ86T26 416 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 LCA5Q86VQ0 697 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 KRT78Q8N1N4 520 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 EXD3Q8N9H8 876 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 DCAKDQ8WVC6 231 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 NXNL1Q96CM4 212 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 SPSB2Q99619 263 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 TMEM79Q9BSE2 394 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 TGIF2Q9GZN2 237 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 NT5DC2Q9H857 520 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 SYNPO2LQ9H987 977 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 SEMA3GQ9NS98 782 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 TMCO1Q9UM00 188 aa18.01■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 FEZF1A0PJY2 475 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 PEX12O00623 359 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 CLGNO14967 610 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 TAPBPO15533 448 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 P2RX6O15547 441 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 OR1F1O43749 312 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP18■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 MED26O95402 600 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 RBP1P09455 135 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 FAM87AP0C7U9 286 aa18■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
SYF2-203ENST00000474160 MMP11P24347 488 aa18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms