RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 DGKAP23743 735 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TNFSF10P50591 281 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 MLLT10P55197 1068 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 RPP38P78345 283 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 MFAP5Q13361 173 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 Q4G0T1 1027 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ARMCX4Q5H9R4 360 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 OR7E24Q6IFN5 339 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SULT1C3Q6IMI6 304 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TRNP1Q6NT89 227 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 UGT3A1Q6NUS8 523 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 CUZD1Q86UP6 607 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 CDK20Q8IZL9 346 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 MINDY2Q8NBR6 621 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 LGALS12Q96DT0 336 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 PKNOX2Q96KN3 472 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 OR1F2PQ96R84 312 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP3K3Q99759 626 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 NEURL2Q9BR09 285 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF747Q9BV97 191 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 NACAP1Q9BZK3 213 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 DPEP3Q9H4B8 488 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ACTR8Q9H981 624 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 VAT1LQ9HCJ6 419 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 MIS18AQ9NYP9 233 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 COPS7AQ9UBW8 275 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 MALT1Q9UDY8 824 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ENTPD4Q9Y227 616 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0G2JNG1 304 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GVT2 93 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 CTAGE9A4FU28 777 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 C5orf60A6NFR6 353 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC169A6NNP5 214 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 E5RGE8 158 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 M0R296 226 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF197O14709 1029 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TSC22D2O75157 780 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 CLDN14O95500 239 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SYF2O95926 243 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SFTPBP07988 381 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 RALAP11233 206 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 HLA-FP30511 346 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 PDIA5Q14554 519 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 KIR2DS5Q14953 304 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC142Q17RM4 750 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATS1Q496A3 300 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 XKR9Q5GH70 373 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 C9orf50Q5SZB4 431 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 CTR9Q6PD62 1173 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 LONP2Q86WA8 852 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 MISPQ8IVT2 679 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 OR2T34Q8NGX1 318 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA22Q8NHS9 363 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TANKQ92844 425 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 GUCD1Q96NT3 240 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC2Q9BYS8 371 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 EBF3Q9H4W6 596 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TLE6Q9H808 572 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 RMND5AQ9H871 391 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM30AQ9NV96 361 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 NARFQ9UHQ1 456 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 TNNQ9UQP3 1299 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 NSG2Q9Y328 171 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-209ENST00000473406 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 CCL24O00175 119 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 CHUKO15111 745 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 GRID2O43424 1007 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 CYTIPO60759 359 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 RAMP2O60895 175 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 LRP3O75074 770 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 GRAP2O75791 330 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 KDM4BO94953 1096 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-209ENST00000473406 RAF1P04049 648 aa5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms