RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472027.1

SYN3-211, Transcript of synapsin III, humanhuman

TSL 4

Gene SYN3, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN3-211ENST00000472027 TFEBP19484 476 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 NR1D1P20393 614 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 FBLP22087 321 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 MMP11P24347 488 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 GGT5P36269 586 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SLC6A12P48065 614 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 RRADP55042 308 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 BMPR2Q13873 1038 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 DSG2Q14126 1118 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 FBXO48Q5FWF7 155 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 VWA2Q5GFL6 755 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CDKL4Q5MAI5 379 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SULT1C3Q6IMI6 304 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TCTN3Q6NUS6 607 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 MRGPREQ86SM8 312 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TMPRSS11BQ86T26 416 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 LAPTM4BQ86VI4 370 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TCAIMQ8N3R3 496 aa8.7□□□□□ -1.02
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SYN3-211ENST00000472027 ZNF740Q8NDX6 193 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 STAG3L4Q8TBR4 150 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 STT3BQ8TCJ2 826 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SLC44A1Q8WWI5 657 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ESAMQ96AP7 390 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 NACC2Q96BF6 587 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 MIEF2Q96C03 454 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 NXNL1Q96CM4 212 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 RHOXF2Q9BQY4 288 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 DRC3Q9H069 523 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SPNS1Q9H2V7 528 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PELI2Q9HAT8 420 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 NMRAL1Q9HBL8 299 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 P4HTMQ9NXG6 502 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 RNF112Q9ULX5 631 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ACOT9Q9Y305 439 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PCM1Q15154 2024 aa8.7□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 A0A087X1B8 175 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 A0A096LPK6 155 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 A6NL46 340 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 H0YIG0 161 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 AGPSO00116 658 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 MASP2O00187 686 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SOCS6O14544 535 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 FFAR3O14843 346 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 GPR42O15529 346 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SUV39H1O43463 412 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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SYN3-211ENST00000472027 TYK2P29597 1187 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SCTRP47872 440 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 AVPR1BP47901 424 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 HSPA7P48741 367 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CSRP3P50461 194 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 IRF9Q00978 393 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 KLC1Q07866 573 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SYT16Q17RD7 645 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PRSS41Q7RTY9 318 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CCDC91Q7Z6B0 441 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PRSS58Q8IYP2 241 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TBC1D19Q8N5T2 526 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 AMER3Q8N944 861 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 PDPRQ8NCN5 879 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 LRRN4CLQ8ND94 238 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 FDCSPQ8NFU4 85 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 OR9A4Q8NGU2 314 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 KCTD4Q8WVF5 259 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 EXT2Q93063 718 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 MOCOSQ96EN8 888 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ATOH8Q96SQ7 321 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 AIF1LQ9BQI0 150 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TMEM79Q9BSE2 394 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CRB3Q9BUF7 120 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SLC25A23Q9BV35 468 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CAPS2Q9BXY5 557 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 TGIF2Q9GZN2 237 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 ALG9Q9H6U8 611 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 MLXIPLQ9NP71 852 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SNX15Q9NRS6 342 aa8.69□□□□□ -1.02
SYN3-211ENST00000472027 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.69□□□□□ -1.02
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