RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	MED4	Q9NPJ6	270 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	WASF3	Q9UPY6	502 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		13.1	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	KNTC1	P50748	2209 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR4F21	O95013	312 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	MSL3P1	P0C860	447 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	HNF4A	P41235	474 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CASP2	P42575	452 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	GABRA4	P48169	554 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	NAA20	P61599	178 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	RELA	Q04206	551 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	LCP2	Q13094	533 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAMK2B	Q13554	666 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TCTE1	Q5JU00	501 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	MED27	Q6P2C8	311 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	WDR34	Q96EX3	536 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CNDP1	Q96KN2	507 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	NLN	Q9BYT8	704 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SYNPO2L	Q9H987	977 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPTBN2	O15020	2390 aa		13.09	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402		A0A1B0GTL3	188 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	FFAR3	O14843	346 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPR42	O15529	346 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	NDUFS4	O43181	175 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF749	O43361	778 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	UGDH	O60701	494 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CRCP	O75575	148 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCRG1	O75711	98 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TIAF1	O95411	115 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	NTRK1	P04629	796 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	FGF5	P12034	268 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	NR1D1	P20393	614 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	BGN	P21810	368 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SCTR	P47872	440 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ERVPABLB-1	P60509	514 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCDH1	Q08174	1060 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	TRAF3	Q13114	568 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	HKDC1	Q2TB90	917 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SYVN1	Q86TM6	617 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ASPG	Q86U10	573 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR8K5	Q8NH50	307 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBE2E3	Q969T4	207 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	THAP11	Q96EK4	314 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF382	Q96SR6	550 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ULBP3	Q9BZM4	244 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		13.08	□□□□□ -0.31
SELENBP1-208	ENST00000447402	C9orf172	C9J069	976 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	UBFD1	O14562	309 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	BRINP1	O60477	761 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	NPHS1	O60500	1241 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHN1	P15882	459 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ALAS2	P22557	587 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	AHR	P35869	848 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	PKNOX1	P55347	436 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	GRM7	Q14831	915 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	LARP7	Q4G0J3	582 aa	Known RBP eCLIP	13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	SGO1	Q5FBB7	561 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	LSMEM2	Q8N112	164 aa		13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
SELENBP1-208	ENST00000447402	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		13.08	□□□□□ -0.32

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