RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 ITGA3P26006 1051 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 FDFT1P37268 417 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 AQP4P55087 323 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 AP2B1P63010 937 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 TUBA3CQ13748 450 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
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PTPRR-204ENST00000440835 TGFBIQ15582 683 aa5.8□□□□□ -1.48
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PTPRR-204ENST00000440835 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
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PTPRR-204ENST00000440835 KYNUQ16719 465 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 LPCAT4Q643R3 524 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 SLC6A19Q695T7 634 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 SYTL1Q8IYJ3 562 aa5.79□□□□□ -1.48
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