RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STX16O14662 325 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MSI1O43347 362 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GUCY1B2O75343 617 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DNAJB5O75953 348 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 OTCP00480 354 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IL1AP01583 271 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNNC2P02585 160 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FYNP06241 537 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IVLP07476 585 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MMP2P08253 660 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYC1P08574 325 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RPSAP08865 295 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DBHP09172 617 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SRCP12931 536 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ETS1P14921 441 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CD82P27701 267 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 AKT2P31751 481 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUDT1P36639 197 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GDNFP39905 211 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARL4AP40617 200 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CLCNKAP51800 687 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARFIP2P53365 341 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIAA1024LP59773 190 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYL6P60660 151 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ST8SIA6P61647 398 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TUBB3Q13509 450 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARHGAP19Q14CB8 494 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IQCB1Q15051 598 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 WDR72Q3MJ13 1102 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FSCBQ5H9T9 825 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PHF19Q5T6S3 580 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HHATQ5VTY9 493 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TCTN3Q6NUS6 607 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UNC13DQ70J99 1090 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RHOUQ7L0Q8 258 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CBWD2Q8IUF1 395 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DDIASQ8IXT1 998 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF679Q8IYX0 411 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC34A3Q8N130 599 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LILRA2Q8N149 483 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KDM8Q8N371 416 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LPCAT1Q8NF37 534 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C3orf49Q96BT1 292 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C14orf79Q96F83 325 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TSPAN17Q96FV3 270 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PEX11GQ96HA9 241 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC45A3Q96JT2 553 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BMFQ96LC9 184 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C5orf34Q96MH7 638 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LMF1Q96S06 567 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 XYLT2Q9H1B5 865 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LRRN3Q9H3W5 708 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SDHAF3Q9NRP4 125 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EHD3Q9NZN3 535 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 EMC3Q9P0I2 261 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF212Q9UDV6 495 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GPR160Q9UJ42 338 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DAPP1Q9UN19 280 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MTMR6Q9Y217 621 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ENTPD4Q9Y227 616 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ASB1Q9Y576 335 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 POLEQ07864 2286 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 VPS13CQ709C8 3753 aa5.49□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRSS38A1L453 326 aa5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 YY2O15391 372 aa5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SULT1B1O43704 296 aa5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 RAD1O60671 282 aa5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MTX2O75431 263 aa5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 STAG3L3P0CL85 134 aa5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAHP16930 419 aa5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHRM3P20309 590 aa5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHRNA3P32297 505 aa5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CAPZA1P52907 286 aa5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP5.48□□□□□ -1.53
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COTL1Q14019 142 aa5.48□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms