RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 BLKP51451 505 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUOXP51687 545 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEC24CP53992 1094 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACTR1AP61163 376 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 BLOC1S1P78537 153 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCL7P80098 99 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NIPAL4Q0D2K0 466 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ILKQ13418 452 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ATP1A4Q13733 1029 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 BMPR2Q13873 1038 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDK2Q15119 407 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ISXQ2M1V0 245 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMZ1Q400G9 498 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 C14orf28Q4W4Y0 310 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 BOLA3Q53S33 107 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF569Q5MCW4 686 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 GKN2Q86XP6 184 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CNGA4Q8IV77 575 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC13Q8IYE1 715 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ULK2Q8IYT8 1036 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 METTL25Q8N6Q8 603 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 C11orf44Q8N8P7 122 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 BEND2Q8NDZ0 799 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR8K1Q8NGG5 319 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPATA22Q8NHS9 363 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SUN3Q8TAQ9 357 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAT14Q8WUY8 206 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNE4Q8WWG9 221 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 XAGE5Q8WWM1 108 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASB12Q8WXK4 309 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT35Q92764 455 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CAVIN3Q969G5 261 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAF2Q96CS3 445 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 AP2M1Q96CW1 435 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 OR2M4Q96R27 311 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR24Q96S15 920 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NUDT22Q9BRQ3 303 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANP32EQ9BTT0 268 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPS8L2Q9H6S3 715 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 C10orf88Q9H8K7 445 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDH9Q9HC56 1237 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ASCL3Q9NQ33 180 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNK6Q9Y257 313 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF711Q9Y462 761 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF215Q9Y6U7 377 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SPTA1P02549 2419 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF462Q96JM2 2506 aa4.35□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCM1Q15154 2024 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCN2AQ99250 2005 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC187A0A096LP49 1063 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A0U1RQJ8 604 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 A0A1W2PQM1 296 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 RRP8O43159 456 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 KLK10O43240 276 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 DHHO43323 396 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PSTPIP1O43586 416 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 BUD23O43709 281 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNX2O60749 519 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MTX2O75431 263 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 USP1O94782 785 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 TNFSF15O95150 251 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ESRRBO95718 433 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 EML2O95834 649 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 MMP2P08253 660 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NPPBP16860 134 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 KRT4P19013 534 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 KELP23276 732 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NFKBIAP25963 317 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ALDH4A1P30038 563 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ACTN2P35609 894 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 ETV5P41161 510 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDKN2BP42772 138 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 PEX5P50542 639 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 STC1P52823 247 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 INHBCP55103 352 aa4.34□□□□□ -1.71
RPS3AP54-201ENST00000435535 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms