RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM131Q92545 1883 aa16.23■□□□□ 0.19
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TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A1W2PQM1 296 aa16.23■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa16.23■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAGEB17A8MXT2 336 aa16.23■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 NPIPB8E9PQR5 432 aa16.23■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 RASSF9O75901 435 aa16.23■□□□□ 0.19
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TOP3BP1-201ENST00000420768 IMPG1Q17R60 797 aa16.23■□□□□ 0.19
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KMT5CQ86Y97 462 aa16.23■□□□□ 0.19
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TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4D9Q8NGE8 314 aa16.23■□□□□ 0.19
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TOP3BP1-201ENST00000420768 C3orf30Q96M34 536 aa16.23■□□□□ 0.19
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ACPTQ9BZG2 426 aa16.23■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CLEC3AO75596 197 aa16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRPH2P23942 346 aa16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TERF2Q15554 542 aa16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZIC1Q15915 447 aa16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMU1Q2TAY7 513 aa16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 STPG1Q5TH74 334 aa16.22■□□□□ 0.19
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TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXO42Q6P3S6 717 aa16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 PLD3Q8IV08 490 aa16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 TUBGCP3Q96CW5 907 aa16.22■□□□□ 0.19
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TOP3BP1-201ENST00000420768 HBEGFQ99075 208 aa16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 SERPINI1Q99574 410 aa16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 NUDT22Q9BRQ3 303 aa16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 KLHL25Q9H0H3 589 aa16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRM3Q9NNZ6 103 aa16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 VPS29Q9UBQ0 182 aa16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 TRIM33Q9UPN9 1127 aa16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 CCL27Q9Y4X3 112 aa16.22■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA8OA6NCC3 632 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 GOLGA8NF8WBI6 632 aa16.21■□□□□ 0.19
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 GDF9O60383 454 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 NRP2O60462 931 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTSVO60911 334 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP6AP2O75787 350 aa16.21■□□□□ 0.19
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PRR35P0CG20 571 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 ACADVLP49748 655 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 LIMK1P53667 647 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 RPS13P62277 151 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 NHLH1Q02575 133 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 PWP1Q13610 501 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 CUL3Q13618 768 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 NR6A1Q15406 480 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 NXNQ6DKJ4 435 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 OGFOD2Q6N063 350 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHSY3Q70JA7 882 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 VN1R5Q7Z5H4 357 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2T11Q8NH01 316 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR52B2Q96RD2 323 aa16.21■□□□□ 0.19
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKTIPQ9H8T0 292 aa16.21■□□□□ 0.19
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TOP3BP1-201ENST00000420768 KLHL3Q9UH77 587 aa16.21■□□□□ 0.19
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