RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420234.5

PUM2-205, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-205	ENST00000420234	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CD82	P27701	267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	GSTM2	P28161	218 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	RBMS1	P29558	406 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CCR7	P32248	378 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	INHBC	P55103	352 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SRSF3	P84103	164 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	MPP1	Q00013	466 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PTPRCAP	Q14761	206 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	NR1D2	Q14995	579 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	RPE65	Q16518	533 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	TCEAL6	Q6IPX3	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PIANP	Q8IYJ0	282 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SYTL1	Q8IYJ3	562 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	GPR135	Q8IZ08	494 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	NAGS	Q8N159	534 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SLC25A45	Q8N413	288 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	VPS37A	Q8NEZ2	397 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	TTL	Q8NG68	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SLC37A2	Q8TED4	501 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PPP4R1	Q8TF05	950 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	TCEAL3	Q969E4	200 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	UBE2E3	Q969T4	207 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	REPS1	Q96D71	796 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	LINGO1	Q96FE5	620 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	VPS50	Q96JG6	964 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	BIRC8	Q96P09	236 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	GPR21	Q99679	349 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	EGFL8	Q99944	293 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ELAC2	Q9BQ52	826 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CCDC3	Q9BQI4	270 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CENPK	Q9BS16	269 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SARG	Q9BW04	601 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	HRASLS2	Q9NWW9	162 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ARL15	Q9NXU5	204 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PI4KA	P42356	2102 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234		A0A096LPK6	155 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234		A0A0U1RQS6	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	GSAP	A4D1B5	854 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	OR5K3	A6NET4	321 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	TLCD2	A6NGC4	264 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	TARM1	B6A8C7	271 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	BTN3A1	O00481	513 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	COPE	O14579	308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	CLGN	O14967	610 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	ATP8B1	O43520	1251 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	NOBOX	O60393	691 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	NIPSNAP2	O75323	286 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	SEMA7A	O75326	666 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	RFPL1	O75677	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	KLHL2	O95198	593 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PUM2-205	ENST00000420234	KCNK5	O95279	499 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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