RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 KREMEN2Q8NCW0 462 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM165Q9HC07 324 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 PRM3Q9NNZ6 103 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ATAD3AQ9NVI7 634 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CD84Q9UIB8 345 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 MTX2O75431 263 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SEMG1P04279 462 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 OR56A5P0C7T3 313 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 PRPS1L1P21108 318 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 PRPH2P23942 346 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGEA8P43361 318 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 WNT3P56703 355 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CREMQ03060 361 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 MTAPQ13126 283 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 MAPK11Q15759 364 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SVOPQ8N4V2 548 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 POF1BQ8WVV4 589 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ASB11Q8WXH4 323 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 HHIPQ96QV1 700 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 DNAJC11Q9NVH1 559 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 YY2O15391 372 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 PCDHGA12O60330 932 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 NUDT7P0C024 238 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CD36P16671 472 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 AQP1P29972 269 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CD70P32970 193 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 RPP38P78345 283 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 PTSQ03393 145 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 LMAN2Q12907 356 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CBLL1Q75N03 491 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 PAGE2Q7Z2X7 111 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ING5Q8WYH8 240 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 LGALS12Q96DT0 336 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 POLE4Q9NR33 117 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1W2PQ67 120 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SCN2BO60939 215 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 WBP4O75554 376 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 C8GP07360 202 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 GPX2P18283 190 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 LHCGRP22888 699 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 MAPK8P45983 427 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 NPRL3Q12980 569 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CDKL4Q5MAI5 379 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TPRG1Q6ZUI0 275 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TCAIMQ8N3R3 496 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 OR2AP1Q8NGE2 309 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 BTBD2Q9BX70 525 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 FBXO8Q9NRD0 319 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 FUT4P22083 530 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SYT16Q17RD7 645 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 PLD3Q8IV08 490 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CADM3Q8N126 398 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SH3KBP1Q96B97 665 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 PRDM8Q9NQV8 689 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 BTBD3Q9Y2F9 522 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 LAMP1P11279 417 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 EPCAMP16422 314 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CATSPEREQ5SY80 951 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 GPR153Q6NV75 609 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 PRSS48Q7RTY5 328 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 GFRA2O00451 464 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 PPM1AP35813 382 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 HNMTP50135 292 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 IRF8Q02556 426 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ERICH5Q6P6B1 374 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC23LQ6PF05 361 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6ZNB5 142 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TMC8Q8IU68 726 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 MAL2Q969L2 176 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SCRN2Q96FV2 425 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 C19orf43Q9BQ61 176 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC46A2Q9BY10 475 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 TPT1P8Q9HAU6 139 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 GRM6O15303 877 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 VIPP01282 170 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 JUPP14923 745 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 CD22P20273 847 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ITGA1P56199 1179 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 HOMEZQ8IX15 550 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP1-202ENST00000417536 ENTHD1Q8IYW4 607 aa18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms