RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM20CQ8IXL6 584 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRT78Q8N1N4 520 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MFSD9Q8NBP5 474 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBTD2Q8WUN7 234 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ANKRD49Q8WVL7 239 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TSNARE1Q96NA8 513 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRAP1Q96NZ9 151 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PAFAH2Q99487 392 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC77Q9BR77 488 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EFCAB11Q9BUY7 163 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TGIF2Q9GZN2 237 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ATG10Q9H0Y0 220 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NT5DC2Q9H857 520 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STARD5Q9NSY2 213 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WWOXQ9NZC7 414 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COPG2Q9UBF2 871 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RNF112Q9ULX5 631 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLHL20Q9Y2M5 609 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC22A7Q9Y694 548 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.17□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A088AWK7 358 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LOC105369274A0A096LPK9 316 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A1W2PQ72 361 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VSTM2BA6NLU5 285 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 STK16O75716 305 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KLHL2O95198 593 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACSL3O95573 720 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDH1P12830 882 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MMP11P24347 488 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TYK2P29597 1187 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MSH2P43246 934 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MAGEA12P43365 314 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SCTRP47872 440 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CSRP3P50461 194 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SOX8P57073 446 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PCDH1Q08174 1060 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDC16Q13042 620 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LAPTM5Q13571 262 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IL10RAQ13651 578 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACAP2Q15057 778 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NKG7Q16617 165 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PAGE2BQ5JRK9 111 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MROH9Q5TGP6 573 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1orf189Q5VU69 101 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MLIPQ5VWP3 458 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ABHD13Q7L211 337 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRGPREQ86SM8 312 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ASPGQ86U10 573 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR4N4Q8N0Y3 316 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLEC1AQ8NC01 280 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NT5CQ8TCD5 201 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NEIL2Q969S2 332 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UBE2E3Q969T4 207 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TM4SF19Q96DZ7 209 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WDR34Q96EX3 536 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C10orf90Q96M02 699 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR4K3Q96R72 315 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPSB2Q99619 263 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CAB39LQ9H9S4 337 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACSS2Q9NR19 701 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNX15Q9NRS6 342 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNAJC11Q9NVH1 559 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CD274Q9NZQ7 290 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NFU1Q9UMS0 254 aa8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa8.15□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MED13Q9UHV7 2174 aa8.15□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CCDC88CQ9P219 2028 aa8.15□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A096LPK6 155 aa8.15□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AGPSO00116 658 aa8.15□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLGNO14967 610 aa8.15□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CEACAM4O75871 244 aa8.15□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WDR47O94967 919 aa8.15□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ALPPP05187 535 aa8.15□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C2P06681 752 aa8.15□□□□□ -1.1
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SERPINA6P08185 405 aa8.15□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms