RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 FAHD1Q6P587 224 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 MINDY2Q8NBR6 621 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 ZNF558Q96NG5 402 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 EPYCQ99645 322 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 SGK2Q9HBY8 427 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 FBXO8Q9NRD0 319 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 HS3ST2Q9Y278 367 aa12.66□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 KRBA1A5PL33 1030 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 GRM6O15303 877 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 SH3BGRLO75368 114 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 GSTM1P09488 218 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 NUDT7P0C024 238 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 CD36P16671 472 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 AQP1P29972 269 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 HLA-FP30511 346 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 CA8P35219 290 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 ASMTP46597 345 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 CSNK2BP67870 215 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 ANXA8L1Q5VT79 327 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 GPR155Q7Z3F1 870 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 CPA6Q8N4T0 437 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 ATL1Q8WXF7 558 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 VOPP1Q96AW1 172 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 LGALS12Q96DT0 336 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 PITX2Q99697 317 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 SIRT5Q9NXA8 310 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 A0A1W2PQ67 120 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 MGAT4DA6NG13 374 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 OR2AG2A6NM03 316 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 PCDHGA12O60330 932 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 NTRK1P04629 796 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 ALOX5P09917 674 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 BMP4P12644 408 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 RRM2P31350 389 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 HNF4AP41235 474 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 RXRGP48443 463 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 GSSP48637 474 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 C21orf58P58505 322 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 SLC7A9P82251 487 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 NAE1Q13564 534 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 HKDC1Q2TB90 917 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 GRHL2Q6ISB3 625 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 GPR153Q6NV75 609 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 Q6ZVU0 165 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 GAREM2Q75VX8 874 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 SNX29P2Q8IUI4 249 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 NPAS3Q8IXF0 933 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 ENTHD1Q8IYW4 607 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 SPPL2AQ8TCT8 520 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 SCAMP4Q969E2 229 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 UBE2FQ969M7 185 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 CEP44Q9C0F1 390 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 FAM83DQ9H4H8 585 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 BTNL2Q9UIR0 455 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 VPS4AQ9UN37 437 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 MAPRE3Q9UPY8 281 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 ERVK-11Q9UQG0 969 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 BTBD3Q9Y2F9 522 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa12.65□□□□□ -0.38
PRAME-201ENST00000398741 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 OR2A25A4D2G3 310 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 ARHGEF33A8MVX0 844 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 H0YIV9 168 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 YY2O15391 372 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 DPM1O60762 260 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 WBP4O75554 376 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 AP2A2O94973 939 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 LCKP06239 509 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 HSD3B1P14060 373 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 HSD3B2P26439 372 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 CLK1P49759 484 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 KCNJ10P78508 379 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 AGTRAPQ6RW13 159 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 GDPD4Q6W3E5 623 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 SLC39A11Q8N1S5 342 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 MFSD4AQ8N468 514 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 CHST14Q8NCH0 376 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 MAL2Q969L2 176 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 ITPKCQ96DU7 683 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 C7orf34Q96L11 122 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 ITPAQ9BY32 194 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 BRF2Q9HAW0 419 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 SH3BP4Q9P0V3 963 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa12.64□□□□□ -0.39
PRAME-201ENST00000398741 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms