RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 TBC1D13Q9NVG8 400 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 GTSE1Q9NYZ3 720 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 NLGN3Q9NZ94 848 aa2.43□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 PASKQ96RG2 1323 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 G3V2L1 256 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 K7EQD1 137 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNAP91O60641 907 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYTIPO60759 359 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 DIAPH2O60879 1101 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 SERPING1P05155 500 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNAH10OSP0CZ25 163 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 FOLR2P14207 255 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL4RP24394 825 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 HSD17B3P37058 310 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ETV5P41161 510 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 CASP2P42575 452 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 RAB28P51157 221 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 LIMK1P53667 647 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBASH3AP57075 661 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACSM1Q08AH1 577 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEL1L3Q68CR1 1132 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR4C11Q6IEV9 310 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 CFAP161Q6P656 301 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 C3P1Q6ZMU1 363 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 TLK2Q86UE8 772 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF584Q8IVC4 421 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 MFN1Q8IWA4 741 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR4C15Q8NGM1 316 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 CHURC1Q8WUH1 139 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 PSMB7Q99436 277 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAF1Q9H063 256 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACTL8Q9H568 366 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 STYXL1Q9Y6J8 313 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 NPHP3Q7Z494 1330 aa2.42□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 A8MU10 97 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 PHOX2AO14813 284 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 GPRIN2O60269 458 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRCH4O75427 683 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLCO2B1O94956 709 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 NXPH4O95158 308 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 BAG3O95817 575 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 HPP00738 406 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 MELTFP08582 738 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 STAG3L1P0CL83 205 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLDN15P56746 228 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERVK-16P61578 105 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 BECN1Q14457 450 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF146Q15072 292 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 DUSP5Q16690 384 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 CRY2Q49AN0 593 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPECC1Q5M775 1068 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 CEACAM19Q7Z692 300 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 RNF130Q86XS8 419 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 MARCH9Q86YJ5 346 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC63Q8NA47 563 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPSB1Q96BD6 273 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 HDAC11Q96DB2 347 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF558Q96NG5 402 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 NDNQ99608 321 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ATF6BQ99941 703 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 PI4K2AQ9BTU6 479 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNAI2Q9GZS0 605 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 ADNPQ9H2P0 1102 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 SNX25Q9H3E2 840 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 PKD2L2Q9NZM6 624 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL36AQ9UHA7 158 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 POMT2Q9UKY4 750 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 IL16Q14005 1332 aa2.41□□□□□ -2.02
RNU6-38P-201ENST00000384085 MTMR11A4FU01 709 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 GLTPD2A6NH11 291 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 SHISA7A6NL88 538 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 K7ENM7 598 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 RTCAO00442 366 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 OGTO15294 1046 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCP11498 1178 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 F3P13726 295 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 MYOGP15173 224 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 ACHEP22303 614 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 DLK1P80370 383 aa2.4□□□□□ -2.03
RNU6-38P-201ENST00000384085 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.5 ms