RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381196.8

PTPRD-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 9,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-203ENST00000381196 CHRNB1P11230 501 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 NTSP30990 170 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ARHGAP8P85298 464 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 OR8H3Q8N146 312 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 RHOXF1Q8NHV9 184 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 MUL1Q969V5 352 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ACDQ96AP0 544 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 SYT4Q9H2B2 425 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 IFT22Q9H7X7 185 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ACSL6Q9UKU0 697 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ENTPD4Q9Y227 616 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 CBY3A6NI87 242 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ACKR2O00590 384 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 RFPL1O75677 317 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 SYN1P17600 705 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 OR1E1P30953 314 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 RAET1GQ6H3X3 334 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 C16orf59Q7L2K0 433 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 MFSD9Q8NBP5 474 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 WDR18Q9BV38 432 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 LIMD1Q9UGP4 676 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 H3BMQ9 156 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 SEPT4O43236 478 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 SOX15O60248 233 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ARP10275 920 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ADH6P28332 368 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 SHMT1P34896 483 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ABCG1P45844 678 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 LBX1P52954 281 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 PARP15Q460N3 678 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 DUSP28Q4G0W2 176 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ARMC12Q5T9G4 340 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 CD276Q5ZPR3 534 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 STPG2Q8N412 459 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 DNAJC22Q8N4W6 341 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 UXS1Q8NBZ7 420 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 PMM1Q92871 262 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 OSTF1Q92882 214 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 RCN3Q96D15 328 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 PCYT2Q99447 389 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 UFSP2Q9NUQ7 469 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 CEPT1Q9Y6K0 416 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ARPC2O15144 300 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 POLR1CO15160 346 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ATG13O75143 517 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 CCL5P13501 91 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 MAP2K4P45985 399 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 GPAT3Q53EU6 434 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ZFAND1Q8TCF1 268 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 KCNJ9Q92806 393 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 HDAC10Q969S8 669 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ZNF382Q96SR6 550 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 FUNDC2Q9BWH2 189 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 OR6A2O95222 327 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 LY86O95711 162 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 SEPHS1P49903 392 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 BCL2A1Q16548 175 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 SEZ6Q53EL9 994 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ACTBL2Q562R1 376 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 C1orf186Q6ZWK4 172 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 LNX2Q8N448 690 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ZNF671Q8TAW3 534 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ALG3Q92685 438 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 OPTCQ9UBM4 332 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 TBC1D24Q9ULP9 559 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 TAF6LQ9Y6J9 622 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 B4GALT4O60513 344 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 SNHG28P0DPA3 235 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 HSPA7P48741 367 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ARSFP54793 590 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 PTPN20Q4JDL3 420 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 C4orf46Q504U0 113 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 C3P1Q6ZMU1 363 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 SNX20Q7Z614 316 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 NPAS4Q8IUM7 802 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 SAMD12Q8N8I0 201 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRD-203ENST00000381196 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa4.75□□□□□ -1.65
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