RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 AP1S2P56377 157 aa7.29□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 OCA2Q04671 838 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 KLC1Q07866 573 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 MYBPC3Q14896 1274 aa7.29□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 IGFBP7Q16270 282 aa7.29□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 CTAGE3PQ8IX95 158 aa7.28□□□□□ -1.24
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SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 AMER3Q8N944 861 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 OR11G2Q8NGC1 345 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CPT1CQ8TCG5 803 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 ATL1Q8WXF7 558 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PNPLA2Q96AD5 504 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 PYCR2Q96C36 320 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 VPS50Q96JG6 964 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 RHOXF2Q9BQY4 288 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC77Q9BR77 488 aa7.28□□□□□ -1.24
SGMS1-201ENST00000361543 HAUS8Q9BT25 410 aa7.28□□□□□ -1.24
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