RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000343380.5

E2F1-201, Transcript of E2F transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene E2F1, Length 2,503 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1-201ENST00000343380 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 DOC2BQ14184 412 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 TPGS1Q6ZTW0 290 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 METTL4Q8N3J2 472 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 ZNF675Q8TD23 568 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 EPYCQ99645 322 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 HOXD1Q9GZZ0 328 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 FZD4Q9ULV1 537 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 ALOX12P18054 663 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 OR1D2P34982 312 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 GGT2P36268 569 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 BMPR1AP36894 532 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 MFSD14CQ5VZR4 134 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CST9Q5W186 159 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 ERICH5Q6P6B1 374 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 GDPD3Q7L5L3 318 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CASD1Q96PB1 797 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 SLC12A9Q9BXP2 914 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CHST8Q9H2A9 424 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa20.32■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CLCA1A8K7I4 914 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 ADORA3P0DMS8 318 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 NSG1P42857 185 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 GAB1Q13480 694 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 USP43Q70EL4 1123 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 ASB11Q8WXH4 323 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 ZNF226Q9NYT6 803 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 NDUFAF4Q9P032 175 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 PCDH7O60245 1069 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 OR1E2P47887 323 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 TP53BP2Q13625 1128 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 GPR33Q49SQ1 333 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CYP27C1Q4G0S4 372 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 FAM9CQ8IZT9 166 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 FCGR1BQ92637 280 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 FKBP14Q9NWM8 211 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 TMEM161AQ9NX61 479 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 SPASTQ9UBP0 616 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa20.31■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 AGAP14A8MT82 685 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 SUV39H1O43463 412 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 LIMK1P53667 647 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 PLD1Q13393 1074 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CDH18Q13634 790 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 C6orf183Q5T699 404 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 LRRC66Q68CR7 880 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 RGMBQ6NW40 437 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CRTC1Q6UUV9 634 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 NAGSQ8N159 534 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CPA6Q8N4T0 437 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 SPPL2AQ8TCT8 520 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 ATL1Q8WXF7 558 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 VOPP1Q96AW1 172 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 KLHL3Q9UH77 587 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 SAGE2PA6NJ88 616 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 HSMCR30P0CW71 290 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CASP3P42574 277 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 VEZF1Q14119 521 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 LRRC73Q5JTD7 316 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 PNCKQ6P2M8 343 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 TUBA3EQ6PEY2 450 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 AMER2Q8N7J2 671 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 OR8J2Q8NGG1 315 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 FCRL1Q96LA6 429 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa20.3■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 PRAMEF25A6NGN4 478 aa20.29■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 GABRR3A8MPY1 467 aa20.29■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 TNFRSF11BO00300 401 aa20.29■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 MTX2O75431 263 aa20.29■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 ETHE1O95571 254 aa20.29■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CBSLP0DN79 551 aa20.29■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CBSP35520 551 aa20.29■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 FLT3LGP49771 235 aa20.29■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 NKX3-2P78367 333 aa20.29■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 CRHR2Q13324 411 aa20.29■□□□□ 0.84
E2F1-201ENST00000343380 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.848e-9■■□□□ 14.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms