RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336128.11

ZNF548-201, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF548, Length 2,115 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-201ENST00000336128 DUOXA1Q1HG43 343 aa11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-201ENST00000336128 TBCELQ5QJ74 424 aa11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-201ENST00000336128 HMBOX1Q6NT76 420 aa11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-201ENST00000336128 GALNT18Q6P9A2 607 aa11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-201ENST00000336128 GCNT7Q6ZNI0 430 aa11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-201ENST00000336128 COMMD6Q7Z4G1 85 aa11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-201ENST00000336128 TICAM1Q8IUC6 712 aa11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-201ENST00000336128 DTWD1Q8N5C7 304 aa11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-201ENST00000336128 WDR48Q8TAF3 677 aa11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-201ENST00000336128 AIF1LQ9BQI0 150 aa11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-201ENST00000336128 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-201ENST00000336128 MVB12BQ9H7P6 319 aa11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-201ENST00000336128 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-201ENST00000336128 EBF1Q9UH73 591 aa11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-201ENST00000336128 MAPRE3Q9UPY8 281 aa11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-201ENST00000336128 AURKCQ9UQB9 309 aa11.96□□□□□ -0.49
ZNF548-201ENST00000336128 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 SAP18O00422 153 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 RFXANKO14593 260 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 APBB3O95704 486 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 SEMA4FO95754 770 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 GGT1P19440 569 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 AKT2P31751 481 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 RAB28P51157 221 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 CCR8P51685 355 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 CTBSQ01459 385 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 CYP51A1Q16850 503 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 GLYATQ6IB77 296 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 ERMP1Q7Z2K6 904 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 PGBD3Q8N328 593 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 METTL4Q8N3J2 472 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 ABHD11Q8NFV4 315 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 OR2T12Q8NG77 320 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 OR8J2Q8NGG1 315 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 OR2L8Q8NGY9 312 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 OR10A6Q8NH74 314 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 NSMCE2Q96MF7 247 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 CCDC115Q96NT0 180 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 GBP5Q96PP8 586 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 ANAPC2Q9UJX6 822 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 ICKQ9UPZ9 632 aa11.96□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 PCM1Q15154 2024 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 FAM220BPB1ANY3 271 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 SCN2BO60939 215 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 LAMP1P11279 417 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 IL10P22301 178 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 CXCR2P25025 360 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 HTR1BP28222 390 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 TRPC1P48995 793 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF763Q0D2J5 394 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 TDGQ13569 410 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 AMIGO2Q86SJ2 522 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 PHACTR4Q8IZ21 702 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 ICA1LQ8NDH6 482 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 OR52E1Q8NGJ3 308 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 MIEF2Q96C03 454 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 BIRC7Q96CA5 298 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 RHBGQ9H310 441 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 ADGRE2Q9UHX3 823 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 BTBD3Q9Y2F9 522 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 GABRR3A8MPY1 467 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 H7BY64 318 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 GSTA4O15217 222 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 ANXA6P08133 673 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 UMPSP11172 480 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 POLE2P56282 527 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 CYP4F2P78329 520 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 MTX3Q5HYI7 312 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 CPTPQ5TA50 214 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 ANO7Q6IWH7 933 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 IRGCQ6NXR0 463 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 RD3Q7Z3Z2 195 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 CAMKMTQ7Z624 323 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 CALHM3Q86XJ0 350 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 CLECL1Q8IZS7 167 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 TNIP2Q8NFZ5 429 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 OR4K1Q8NGD4 311 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 PRAP1Q96NZ9 151 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 TBCDQ9BTW9 1192 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 DUSP26Q9BV47 211 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 NT5DC2Q9H857 520 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 ATP6V1HQ9UI12 483 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 INVSQ9Y283 1065 aa11.95□□□□□ -0.5
ZNF548-201ENST00000336128 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms