RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317063.10

CHTF18-202, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CHTF18, Length 2,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-202ENST00000317063 HMGCS1Q01581 520 aa15.73■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 RPA4Q13156 261 aa15.73■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 SFT2D3Q587I9 215 aa15.73■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 Q6ZSR9 355 aa15.73■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 ARPINQ7Z6K5 226 aa15.73■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 NSL1Q96IY1 281 aa15.73■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 C1orf50Q9BV19 199 aa15.73■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 C12orf4Q9NQ89 552 aa15.73■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa15.73■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 E7ENX8 843 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 SH3BP5O60239 455 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 CLDN9O95484 217 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 IDSP22304 550 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 ACTR1BP42025 376 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 ACTR1AP61163 376 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 TAP2Q03519 686 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 CATSPEREQ5SY80 951 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 TCAIMQ8N3R3 496 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 GALNT4Q8N4A0 578 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 OR5K2Q8NHB8 316 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 PATE1Q8WXA2 126 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 NEIL2Q969S2 332 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 TIMM29Q9BSF4 260 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 NTMT1Q9BV86 223 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 ACSL5Q9ULC5 683 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 ERVK-11Q9UQG0 969 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 MEI4A8MW99 385 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 WNT1P04628 370 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 PSMB5P28074 263 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 KLF10Q13118 480 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 XKR6Q5GH73 641 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 CDKL4Q5MAI5 379 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 PDSS2Q86YH6 399 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 OR9I1Q8NGQ6 314 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 NUDT8Q8WV74 236 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 HSPA12BQ96MM6 686 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 BTBD10Q9BSF8 475 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 UBDO15205 165 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 GYG2O15488 501 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 TSPAN9O75954 239 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 NPPBP16860 134 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 ZNF12P17014 697 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 DIO3P55073 304 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 KRT33BQ14525 404 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 MMEL1Q495T6 779 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 PRM3Q9NNZ6 103 aa15.72■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 METTL12A8MUP2 240 aa15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 EBLN1P0CF75 366 aa15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 PNLIPRP1P54315 467 aa15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 IRF8Q02556 426 aa15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 DOC2AQ14183 400 aa15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 SFRP1Q8N474 314 aa15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 OR56A3Q8NH54 315 aa15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 RAD51AP1Q96B01 352 aa15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 PDYNP01213 254 aa15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC159P0C7I6 412 aa15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 KELP23276 732 aa15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 FZD2Q14332 565 aa15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 UNC5DQ6UXZ4 953 aa15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 NRROSQ86YC3 692 aa15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 ATL1Q8WXF7 558 aa15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CHTF18-202ENST00000317063 LRP4O75096 1905 aa15.71■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 ULK1O75385 1050 aa15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 RPS9P46781 194 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 RABIFP47224 123 aa15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 YPEL5P62699 121 aa15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 RPE65Q16518 533 aa15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 CYP2A13Q16696 494 aa15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 UAP1L1Q3KQV9 507 aa15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 HMGCLL1Q8TB92 370 aa15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 KLHDC7BQ96G42 594 aa15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 CEPT1Q9Y6K0 416 aa15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 PRR19A6NJB7 356 aa15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 MANBAO00462 879 aa15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 NR4A1P22736 598 aa15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 AQP4P55087 323 aa15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 TMPRSS11BQ86T26 416 aa15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 FANCEQ9HB96 536 aa15.7■□□□□ 0.1
CHTF18-202ENST00000317063 CCDC167Q9P0B6 97 aa15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms