RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316412.9

PRAMEF20-201, Transcript of PRAME family member 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRAMEF20, Length 1,597 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20-201ENST00000316412 ETHE1O95571 254 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 PVRP15151 417 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 PNLIPP16233 465 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 ALDH4A1P30038 563 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 BCL6P41182 706 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 RPS13P62277 151 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 KIAA0040Q15053 153 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 NR6A1Q15406 480 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 PROX2Q3B8N5 592 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 NKAIN2Q5VXU1 208 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 GUSBP11Q6P575 273 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 OR6C4Q8NGE1 309 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZUFSPQ96AP4 578 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCDC74AQ96AQ1 378 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 PPP3R2Q96LZ3 170 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CATSPER2Q96P56 530 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 EPB41L1Q9H4G0 881 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 SYNPO2LQ9H987 977 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 EPHA6Q9UF33 1036 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 ADGRE2Q9UHX3 823 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 TRIM33Q9UPN9 1127 aa16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 EBAG9O00559 213 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 OR1F1O43749 312 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 ERVK-8P63133 956 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CFHR1Q03591 330 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 RELAQ04206 551 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 IMPG1Q17R60 797 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 SMU1Q2TAY7 513 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 AP5B1Q2VPB7 878 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 GALNTL6Q49A17 601 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 FBXO42Q6P3S6 717 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPATA19Q7Z5L4 167 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CLNKQ7Z7G1 428 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 ERP27Q96DN0 273 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 MARK4Q96L34 752 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 SEMA6CQ9H3T2 930 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 LRTM1Q9HBL6 345 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 C1orf109Q9NX04 203 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZFP69BQ9UJL9 534 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 PILRAQ9UKJ1 303 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 FAM186AA6NE01 2351 aa16.61■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 ANKDD1BA6NHY2 528 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 UBDO15205 165 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZW10O43264 779 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRAMEF10O60809 474 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CTSVO60911 334 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CD1CP29017 333 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 SERPINB1P30740 379 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 GRK3P35626 688 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 GPLD1P80108 840 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 EMX2Q04743 252 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 NAA25Q14CX7 972 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZIC1Q15915 447 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 PERM1Q5SV97 790 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 FAM91A1Q658Y4 838 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 IRGCQ6NXR0 463 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPRED1Q7Z699 444 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZFAND4Q86XD8 727 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 MFSD9Q8NBP5 474 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CREB3L4Q8TEY5 395 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CMTM7Q96FZ5 175 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 APIPQ96GX9 242 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCDC106Q9BWC9 280 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 KLHL25Q9H0H3 589 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 ARMCX1Q9P291 453 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 VPS29Q9UBQ0 182 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLC12A4Q9UP95 1085 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CPED1A4D0V7 1026 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CASC3O15234 703 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 TGFB1P01137 390 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CKMT1AP12532 417 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 EZRP15311 586 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 ST6GAL1P15907 406 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 AHRP35869 848 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 GFERP55789 205 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 CYP4F2P78329 520 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 PHEXP78562 749 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPEM2Q0P670 501 aa16.6■□□□□ 0.25
PRAMEF20-201ENST00000316412 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms