RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 PCDHGB4Q9UN71 923 aa20.55■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa20.55■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa20.55■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 MAN2B1O00754 1011 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 CDH1P12830 882 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 MAPK1P28482 360 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 PTPN6P29350 595 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 RAE1P78406 368 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 CYP4F3Q08477 520 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 MED21Q13503 144 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 NFATC4Q14934 902 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 UBXN2BQ14CS0 331 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 GLYATQ6IB77 296 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 OR7A2PQ8NGA2 310 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 OR10A6Q8NH74 314 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 TESCQ96BS2 214 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 BIRC7Q96CA5 298 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 TAC3Q9UHF0 121 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 C7orf72A4D263 438 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 IGHV4-34P06331 123 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 FZD5Q13467 585 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 UGT8Q16880 541 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 OR4F3Q6IEY1 312 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 LINC01555Q8NAE3 123 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 PDP2Q9P2J9 529 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa20.54■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 MT-ND1P03886 318 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 ERGP11308 486 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 ACPPP15309 386 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 DGKEP52429 567 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 KIAA1024LP59773 190 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 RPS13P62277 151 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 C6orf52Q5T4I8 152 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 SLC30A9Q6PML9 568 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 NXPE4Q6UWF7 544 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 SYT12Q8IV01 421 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 TBC1D21Q8IYX1 336 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 GOLM1Q8NBJ4 401 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 OR2M4Q96R27 311 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 AP4B1Q9Y6B7 739 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 PIPSLA2A3N6 862 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 PI15O43692 258 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 IDSP22304 550 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 PXNP49023 591 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 ZNF33BQ06732 778 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 GK3PQ14409 553 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 ATG9BQ674R7 924 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 MED27Q6P2C8 311 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 SYT13Q7L8C5 426 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 EPHX4Q8IUS5 362 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 DENND6BQ8NEG7 585 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 CDC26Q8NHZ8 85 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 TBCDQ9BTW9 1192 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 TBC1D29Q9UFV1 150 aa20.53■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 A0A1W2PPV9 198 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 RPN2P04844 631 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 GPIP06744 558 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 BMP2P12643 396 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 GGT1P19440 569 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 PRKCQQ04759 706 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 PDK3Q15120 406 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 LRIF1Q5T3J3 769 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 ANKFN1Q8N957 763 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 TRPV3Q8NET8 790 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 GPR156Q8NFN8 814 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 WDR34Q96EX3 536 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 WDR92Q96MX6 357 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 CAMK1GQ96NX5 476 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 GPR174Q9BXC1 333 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 TMEM168Q9H0V1 697 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 KCNH6Q9H252 994 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 BRF2Q9HAW0 419 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 UBAP1Q9NZ09 502 aa20.52■□□□□ 0.88
SOX17-201ENST00000297316 SAC3D1A6NKF1 404 aa20.52■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 YY2O15391 372 aa20.52■□□□□ 0.87
SOX17-201ENST00000297316 IL10P22301 178 aa20.52■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms