RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265616.9

UBXN8-201, Transcript of UBX domain protein 8, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN8, Length 1,450 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8-201ENST00000265616 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 ZNF417Q8TAU3 575 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 SELENOMQ8WWX9 145 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 REPS1Q96D71 796 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 PPP1R16AQ96I34 528 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 LRIG1Q96JA1 1093 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 FRG2BQ96QU4 278 aa7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 CLSTN3Q9BQT9 956 aa7.55□□□□□ -1.2
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UBXN8-201ENST00000265616 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
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UBXN8-201ENST00000265616 TRIM16O95361 564 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 SEC24AO95486 1093 aa7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-201ENST00000265616 HTR1AP08908 422 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-201ENST00000265616 EPORP19235 508 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 MATN1P21941 496 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 PCGF2P35227 344 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 SOX18P35713 384 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 UGT2B10P36537 528 aa7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-201ENST00000265616 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 TMED1Q13445 227 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 GPNMBQ14956 572 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 PLCL1Q15111 1095 aa7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-201ENST00000265616 DGUOKQ16854 277 aa7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-201ENST00000265616 YIPF6Q96EC8 236 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 WDR34Q96EX3 536 aa7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-201ENST00000265616 VPS35Q96QK1 796 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 SIGLEC11Q96RL6 698 aa7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-201ENST00000265616 MROQ9BYG7 248 aa7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-201ENST00000265616 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
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UBXN8-201ENST00000265616 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 LTBP2Q14767 1821 aa7.54□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 ANKRD12Q6UB98 2062 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 IQCF5A8MTL0 148 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 CLIC1O00299 241 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 ADAMDEC1O15204 470 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 HS6ST1O60243 411 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 NOBOXO60393 691 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 SCN2BO60939 215 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 ANGPTL1O95841 491 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 PDYNP01213 254 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 IFNA14P01570 189 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 C9P02748 559 aa7.53□□□□□ -1.2
UBXN8-201ENST00000265616 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
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