RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258499.7

USP44-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 44, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP44, Length 4,022 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44-201ENST00000258499 MLLT10P55197 1068 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 GABARAPL2P60520 117 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 SP3Q02447 781 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 MGAT3Q09327 533 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 LMAN2Q12907 356 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 HSPB3Q12988 150 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 DOC2AQ14183 400 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TSTQ16762 297 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ANXA8L1Q5VT79 327 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 XAF1Q6GPH4 301 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TMEM53Q6P2H8 277 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TMEM220Q6QAJ8 160 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 AGTRAPQ6RW13 159 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 HMGN2P46Q86SG4 172 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ZNF683Q8IZ20 524 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 SLC5A8Q8N695 610 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ZNF461Q8TAF7 563 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 XAGE5Q8WWM1 108 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 STARD8Q92502 1023 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 NACC2Q96BF6 587 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 AP2M1Q96CW1 435 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 DEPDC7Q96QD5 511 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ALPK1Q96QP1 1244 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 YME1L1Q96TA2 773 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 P2RY13Q9BPV8 354 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TRIM39Q9HCM9 518 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 IL1RAPQ9NPH3 570 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 DYRK4Q9NR20 520 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 VNN3Q9NY84 501 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ASF1AQ9Y294 204 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa4.59□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 E7EQ34 232 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 INPPL1O15357 1258 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ELFN1P0C7U0 828 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ITGA2P17301 1181 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 FEN1P39748 380 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ASMTP46597 345 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 MANFP55145 182 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 RPS26P62854 115 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 IL18R1Q13478 541 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 SCARB2Q14108 478 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 DPY19L1Q2PZI1 675 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 MPPE1Q53F39 396 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 RAET1GQ6H3X3 334 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 CRTC1Q6UUV9 634 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 USP51Q70EK9 711 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 NPAS3Q8IXF0 933 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 NAGSQ8N159 534 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 AQP11Q8NBQ7 271 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 OR9Q2Q8NGE9 314 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ZNF675Q8TD23 568 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 SORCS1Q8WY21 1168 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 SLC38A4Q969I6 547 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ZNF558Q96NG5 402 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 OR51E2Q9H255 320 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 MTG2Q9H4K7 406 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ACOT13Q9NPJ3 140 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ERVK13-1Q9NX77 482 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 MS4A12Q9NXJ0 267 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TAS2R16Q9NYV7 291 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 LHX3Q9UBR4 397 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 MALT1Q9UDY8 824 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ANGPT4Q9Y264 503 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 UPK1AO00322 258 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TSPAN6O43657 245 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TLL1O43897 1013 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 TSC22D2O75157 780 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 SERPINB7O75635 380 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 AP2A2O94973 939 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 STATHP02808 62 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 IFNW1P05000 195 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 KLK1P06870 262 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 CR2P20023 1033 aa4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 PPIBP23284 216 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
USP44-201ENST00000258499 ETV3P41162 512 aa4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.8 ms