RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CYC1P08574 325 aa15.42■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS56P0CW18 603 aa15.42■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 GLI4P10075 376 aa15.42■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 ERVK-10P10266 1014 aa15.42■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 PSMB5P28074 263 aa15.42■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 GPR33Q49SQ1 333 aa15.42■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 BBS12Q6ZW61 710 aa15.42■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 SLC5A8Q8N695 610 aa15.42■□□□□ 0.06
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SPCS1-201ENST00000233025 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa15.42■□□□□ 0.06
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SPCS1-201ENST00000233025 C10orf88Q9H8K7 445 aa15.42■□□□□ 0.06
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SPCS1-201ENST00000233025 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP15.41■□□□□ 0.06
SPCS1-201ENST00000233025 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP15.4■□□□□ 0.065e-6■■■□□ 16
SPCS1-201ENST00000233025 OR2A25A4D2G3 310 aa15.4■□□□□ 0.06
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SPCS1-201ENST00000233025 I3L1I5 382 aaPredicted RBP15.39■□□□□ 0.05
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SPCS1-201ENST00000233025 ITGA8P53708 1063 aa15.38■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 GEMP55040 296 aa15.38■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 GARNL3Q5VVW2 1013 aa15.38■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 FBXO42Q6P3S6 717 aa15.38■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC8BQ6P9F7 803 aa15.38■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
SPCS1-201ENST00000233025 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
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