RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000077935.5

Trps1-201, Transcript of Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trps1, Length 4,436 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nup107Q8BH74 926 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 FicdQ8BIX9 458 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Znf410Q8BKX7 478 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ckap4Q8BMK4 575 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Fam46bQ8C152 427 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hist1h2afQ8CGP5 130 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hist1h2ahQ8CGP6 128 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hist1h2akQ8CGP7 130 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 GrpQ8R1I2 146 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 H2afjQ8R1M2 129 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tspan8Q8R3G9 235 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ints14Q8R3P6 515 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Crtc3Q91X84 619 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Golm1Q91XA2 393 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Slc8b1Q925Q3 585 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 PompQ9CQT5 141 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cab39lQ9DB16 337 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Copg1Q9QZE5 874 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sh2d3cQ9QZS8 854 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Btbd35f16A0A087WSN2 498 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp993A2A8V4 313 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm5072A2AHM1 344 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 CerklA2AQH1 525 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 ZxdbA2CE44 873 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp992B1ASD8 573 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 PiggD3Z3Y1 983 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Kpna4O35343 521 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 P01644 108 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 P01645 108 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 P01646 108 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 P01647 108 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Timp2P25785 220 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Sult2a1P52843 285 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Lim2P56563 173 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 PrkcgP63318 697 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hrh2P97292 397 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cfhr2Q4LDF6 332 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nfatc2Q60591 927 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Capn3Q64691 821 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmem151bQ68FE7 561 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Znf366Q6NS86 746 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Prrt3Q6PE13 971 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Clec7aQ6QLQ4 244 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Dnajc16Q80TN4 772 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tmcc2Q80W04 706 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Casp9Q8C3Q9 454 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Bhlhe22Q8C6A8 355 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tp53inp2Q8CFU8 221 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mark4Q8CIP4 752 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp991Q8R1N3 573 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn1r185Q8R299 319 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mul1Q8VCM5 352 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr1276Q8VF40 312 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr700Q8VFM5 316 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Q91W34 466 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm26657Q9CVR1 127 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Spag4Q9JJF2 443 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ulk2Q9QY01 1037 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Med20Q9R0X0 212 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mad2l1Q9Z1B5 205 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nup210lQ9D2F7 1881 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Auts2A0A087WPF7 1261 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Cyp4a30bA0A087WS15 508 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm33543A0A1B0GSI5 81 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp534A2A7A1 661 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Nhsl2B1AXH1 854 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn2r24D3YUI0 854 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn2r18E9Q280 788 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp988F6VKC7 633 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mllt10O54826 1068 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Suv39h1O54864 412 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Stc1O55183 247 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 P04214 136 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 MpoP11247 718 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 BckdhaP50136 442 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Plscr4P58196 326 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 ElocP83940 112 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Smpd1Q04519 627 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zfp987Q32P14 633 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 KhsrpQ3U0V1 748 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Arhgap20Q6IFT4 1182 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Osgepl1Q6PEB4 414 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr384Q7TRX8 312 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 GnsQ8BFR4 544 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Q8BH50 245 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Zmiz2Q8CIE2 920 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr1504Q8VFQ4 315 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Prmt3Q922H1 532 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Hspa14Q99M31 509 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 OgfrQ99PG2 633 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Mau2Q9D2X5 619 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Ccdc3Q9D6Y1 273 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 B3galt5Q9JI67 308 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 TesminQ9WTJ6 475 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Epb41l1Q9Z2H5 879 aa6.84□□□□□ -1.31
Trps1-201ENSMUST00000077935 Olfr485A0A140LJF5 317 aa6.83□□□□□ -1.32
Trps1-201ENSMUST00000077935 Gm6811E9Q3Y8 510 aa6.83□□□□□ -1.32
Trps1-201ENSMUST00000077935 Vmn1r176G3UW31 304 aa6.83□□□□□ -1.32
Trps1-201ENSMUST00000077935 Tpst2O88856 376 aa6.83□□□□□ -1.32
Trps1-201ENSMUST00000077935 AldoaP05064 364 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.4 ms