RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027404.11

Ptprn-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptprn, Length 3,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm9857F7CXR1 130 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ikzf3O08900 507 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Clk3O35492 638 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fcgr2P08101 330 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Alox5P48999 674 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Laptm4aQ60961 233 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Colgalt2Q6NVG7 625 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nrip1Q8CBD1 1161 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr357Q8VFP4 308 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr345Q8VGK4 311 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Asb9Q91ZT8 290 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zswim1Q9CWV7 455 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Acbd7Q9D258 88 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm21885A0A286YDN8 145 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ech1O35459 327 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cbx4O55187 551 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 March5Q3KNM2 278 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Usp39Q3TIX9 564 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hhla1Q3TYV2 514 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmem253Q3UNB8 204 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Itga7Q61738 1179 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olig3Q6PFG8 273 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hfe2Q7TQ32 420 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Micu2Q8CD10 432 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Coq9Q8K1Z0 313 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf639Q99KZ6 485 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Desi1Q9CQT7 168 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smarcb1Q9Z0H3 385 aa15.59■□□□□ 0.09
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam46dB1ATX6 390 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Smim18J3QNP2 93 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Znf143O70230 638 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il1aP01582 270 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gja1P23242 382 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gabarapl2P60521 117 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gbx1P82976 418 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mmp11Q02853 492 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q3UST5 385 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpr165Q3V3A3 455 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hamp2Q80T19 83 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Plxna4Q80UG2 1893 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bcas1Q80YN3 633 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Glt28d2Q8BML3 165 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fastkd3Q8BSN9 661 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Wdr47Q8CGF6 920 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ly6g5cQ8K1T5 149 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Nudt4Q8R2U6 179 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 DhrsxQ8VBZ0 335 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gbgt1Q8VI38 347 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ptov1Q91VU8 416 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cacna1dQ99246 2179 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Klhl28Q9CR40 571 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cep97Q9CZ62 856 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Q9D454 513 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Ndufs3Q9DCT2 263 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr706Q9EPF8 316 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Kcne5Q9QZ26 143 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fkbp9Q9Z247 570 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Esp18A8R0V1 91 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Il20rbE9Q9A6 308 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm8334F7CD45 553 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Grik2P39087 908 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Aff3P51827 1254 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 HccsP53702 272 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 VldlrP98156 873 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp935Q14DI0 353 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gpat2Q14DK4 801 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Jmjd8Q3TA59 316 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam189bQ5HZJ5 669 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hsd3b5Q61694 373 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Bfsp2Q6NVD9 416 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Olfr1288Q7TQY0 312 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SntnQ8C9X1 147 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Unc5aQ8K1S4 898 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Tmeff2Q9QYM9 374 aa15.58■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 A6H6Q4 206 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fbxw9F8VPX2 458 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Mkln1O89050 735 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cpa3P15089 417 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Hnf1bP27889 558 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Htr1bP28334 386 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 H2-M3Q31093 336 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 PomkQ3TUA9 349 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zhx3Q8C0Q2 951 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 NrmQ8VC65 262 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rpl4Q9D8E6 419 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Fam122aQ9DB52 284 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm5565A0A0G2JGB2 317 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm30302A0A1Y7VN40 1110 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r91E9Q2U5 856 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Gm16494E9Q2Z4 87 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 4930579F01RikE9Q3L6 325 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Vmn2r3H3BJ88 915 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Atxn2O70305 1285 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Cd9P40240 226 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Yap1P46938 488 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 TshrP47750 764 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Flt3lgP49772 232 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 SmoP56726 793 aa15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Rack1P68040 317 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
Ptprn-201ENSMUST00000027404 Zfp280bQ505F4 534 aa15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.4 ms