RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612980.4

RDM1-215, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene RDM1, Length 501 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-215	ENST00000612980	TRPV3	Q8NET8	790 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	LPCAT1	Q8NF37	534 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	OR9I1	Q8NGQ6	314 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ADAMTS16	Q8TE57	1224 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	DDI1	Q8WTU0	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	LRRC58	Q96CX6	371 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF382	Q96SR6	550 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	MUC3B	Q9H195	1237 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	CCDC68	Q9H2F9	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	MUC13	Q9H3R2	512 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	SEMA6C	Q9H3T2	930 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980		Q9H521	79 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	COQ10B	Q9H8M1	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	RDH14	Q9HBH5	336 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	IL26	Q9NPH9	171 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ACTR3B	Q9P1U1	418 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	VPS51	Q9UID3	782 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	APPL1	Q9UKG1	709 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	FIS1	Q9Y3D6	152 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	TIMM22	Q9Y584	194 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ATR	Q13535	2644 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	RP1L1	Q8IWN7	2480 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	FAM234B	A2RU67	622 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ASPDH	A6ND91	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	C9orf172	C9J069	976 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980		K7ERQ8	282 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	TLR4	O00206	839 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	EIF3F	O00303	357 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	BTN3A1	O00481	513 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	DLGAP1	O14490	977 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	OR7A17	O14581	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ACOX3	O15254	700 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ZG16	O60844	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	SOCS5	O75159	536 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	NIPSNAP2	O75323	286 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	SUPT3H	O75486	399 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	EED	O75530	441 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	SLC22A3	O75751	556 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	WDR47	O94967	919 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	OR4F21	O95013	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	TRBC1	P01850	177 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	GP1BA	P07359	652 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	CBSL	P0DN79	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	C7	P10643	843 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	TCN1	P20061	433 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	MSH3	P20585	1137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	CBS	P35520	551 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	GGT5	P36269	586 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	CSK	P41240	450 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	SLC7A2	P52569	658 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ART1	P52961	327 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	DIO3	P55073	304 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	RHOA	P61586	193 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	UFM1	P61960	85 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	PPP2CB	P62714	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ERVK-8	P63133	956 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	PPP2CA	P67775	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	MYBPC1	Q00872	1141 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ENPP2	Q13822	863 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	RCAN2	Q14206	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	ZNF234	Q14588	700 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	RPS6KA2	Q15349	733 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	NR6A1	Q15406	480 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	GEN1	Q17RS7	908 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	MYLK3	Q32MK0	819 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RDM1-215	ENST00000612980	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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