RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	MGAT1	P26572	445 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	PTGER4	P35408	488 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	KIF5A	Q12840	1032 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	NAA25	Q14CX7	972 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	C3AR1	Q16581	482 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC89	Q8N998	374 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGEC3	Q8TD91	643 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF480	Q8WV37	535 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	NPAS2	Q99743	824 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	HES7	Q9BYE0	225 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	IL22	Q9GZX6	179 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	TINAG	Q9UJW2	476 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		11.3	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338		E7ENX8	843 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	SMAP	O00193	183 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	MAN1A2	O60476	641 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	ESR1	P03372	595 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	PNLIPRP1	P54315	467 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	BASP1	P80723	227 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	TAP2	Q03519	686 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	RPTN	Q6XPR3	784 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	CENPU	Q71F23	418 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	VN1R4	Q7Z5H5	301 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	ADCK2	Q7Z695	626 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	REXO1L1P	Q8IX06	675 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF295-AS1	Q8N0V1	137 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	BEST3	Q8N1M1	668 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	KIFC1	Q9BW19	673 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPAN10	Q9H1Z9	355 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	MED16	Q9Y2X0	877 aa		11.29	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	MED13L	Q71F56	2210 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338		A8MUI8	341 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNHIT1	O43257	154 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	CCNDBP1	O95273	360 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	COX6B1	P14854	86 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	CHRM3	P20309	590 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	CLCN7	P51798	805 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	ADAR	P55265	1226 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	GTF3C1	Q12789	2109 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	CUL1	Q13616	776 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM53B	Q14153	422 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	BTBD16	Q32M84	506 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF766	Q5HY98	468 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	MRNIP	Q6NTE8	343 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	MDS2	Q8NDY4	140 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	RUBCNL	Q9H714	662 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	CHST11	Q9NPF2	352 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD10	Q9NXR5	420 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	STMN3	Q9NZ72	180 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	BFAR	Q9NZS9	450 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	SOX13	Q9UN79	622 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		11.28	□□□□□ -0.6
TTLL3-233	ENST00000602338		H3BMM5	538 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338		H7BY64	318 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ICAM2	P13598	275 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	IL1RN	P18510	177 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	IMPA1	P29218	277 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	XCR1	P46094	333 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	NPY2R	P49146	381 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	RIPPLY3	P57055	190 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP10-9	P60411	292 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	RELA	Q04206	551 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	TUBA3C	Q13748	450 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	ACER2	Q5QJU3	275 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		11.27	□□□□□ -0.61
TTLL3-233	ENST00000602338	MTFR2	Q6P444	385 aa		11.27	□□□□□ -0.61

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