RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 CXCR2P25025 360 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-206ENST00000588345 CDC16Q13042 620 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-206ENST00000588345 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-206ENST00000588345 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
CTIF-206ENST00000588345 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa17.35■□□□□ 0.37
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CTIF-206ENST00000588345 LINC00696Q6ZRV3 163 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-206ENST00000588345 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
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CTIF-206ENST00000588345 GRHL3Q8TE85 626 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-206ENST00000588345 GRK7Q8WTQ7 553 aa17.35■□□□□ 0.37
CTIF-206ENST00000588345 FAR1Q8WVX9 515 aa17.35■□□□□ 0.37
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CTIF-206ENST00000588345 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP17.34■□□□□ 0.37
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CTIF-206ENST00000588345 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
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CTIF-206ENST00000588345 YIPF2Q9BWQ6 316 aa17.34■□□□□ 0.37
CTIF-206ENST00000588345 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
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CTIF-206ENST00000588345 RIC8BQ9NVN3 520 aa17.34■□□□□ 0.37
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CTIF-206ENST00000588345 TEX15Q9BXT5 2789 aa17.33■□□□□ 0.36
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CTIF-206ENST00000588345 TAS2R13Q9NYV9 303 aa17.32■□□□□ 0.36
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CTIF-206ENST00000588345 DYTNA2CJ06 578 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-206ENST00000588345 GABRB3P28472 473 aa17.31■□□□□ 0.36
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CTIF-206ENST00000588345 ARG2P78540 354 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-206ENST00000588345 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CTIF-206ENST00000588345 INAQ16352 499 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-206ENST00000588345 SPANXN3Q5MJ09 141 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-206ENST00000588345 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
CTIF-206ENST00000588345 FAAH2Q6GMR7 532 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-206ENST00000588345 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CTIF-206ENST00000588345 AGTRAPQ6RW13 159 aa17.31■□□□□ 0.36
CTIF-206ENST00000588345 KIAA0408Q6ZU52 694 aa17.31■□□□□ 0.36
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