RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ITPKB	P27987	946 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	VSX2	P58304	361 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	NFKB2	Q00653	900 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PCDH1	Q08174	1060 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	11.33	□□□□□ -0.6	1e-8	■■■■■ 54.2
USP22-211	ENST00000584538	PDK4	Q16654	411 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ST3GAL2	Q16842	350 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	LCN10	Q6JVE6	187 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	RHBDD2	Q6NTF9	364 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	C16orf46	Q6P387	395 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ADCK2	Q7Z695	626 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	VASH2	Q86V25	355 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ZIM3	Q96PE6	472 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	GBP5	Q96PP8	586 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	RUFY1	Q96T51	708 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	AICDA	Q9GZX7	198 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ZZEF1	O43149	2961 aa		11.33	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	FEZF1	A0PJY2	475 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538		K7EPI3	171 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	E2F3	O00716	465 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	STX16	O14662	325 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	EFS	O43281	561 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	MAP3K7	O43318	606 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	GLRA3	O75311	464 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	STATH	P02808	62 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	MT-ND3	P03897	115 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	GFAP	P14136	432 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	KRT15	P19012	456 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	F8A1	P23610	371 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	SCTR	P47872	440 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CCR8	P51685	355 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ABHD18	Q0P651	414 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PFKFB4	Q16877	469 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	HKDC1	Q2TB90	917 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TCTE1	Q5JU00	501 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	COX15	Q7KZN9	410 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	ESX1	Q8N693	406 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CT55	Q8WUE5	264 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	APOPT1	Q96IL0	206 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	SCYL1	Q96KG9	808 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	DPH1	Q9BZG8	443 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	EHD1	Q9H4M9	534 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	LHX9	Q9NQ69	397 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	SLC22A11	Q9NSA0	550 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	STARD5	Q9NSY2	213 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	OPTC	Q9UBM4	332 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	SERTAD3	Q9UJW9	196 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PCTP	Q9UKL6	214 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	KCNE2	Q9Y6J6	123 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		11.32	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	TLDC2	A0PJX2	215 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	C4orf51	C9J302	202 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	DSCR3	O14972	297 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	KLK10	O43240	276 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	DLX3	O60479	287 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	PLIN3	O60664	434 aa		11.31	□□□□□ -0.6
USP22-211	ENST00000584538	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6

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