RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550655.5

CS-219, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-219ENST00000550655 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 MVB12AQ96EY5 273 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 IP6K3Q96PC2 410 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 TRIM54Q9BYV2 358 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 GPAMQ9HCL2 828 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 ZNF304Q9HCX3 659 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 MLXIPLQ9NP71 852 aa16.89■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 FOXS1O43638 330 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 STATHP02808 62 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 BCL6P41182 706 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 CCL11P51671 97 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 TSNQ15631 228 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 FBF1Q8TES7 1133 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 ATL1Q8WXF7 558 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 HAUS8Q9BT25 410 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 SLC25A23Q9BV35 468 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 DERL2Q9GZP9 239 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 TXNDC16Q9P2K2 825 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 OARD1Q9Y530 152 aa16.88■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 FEZF1A0PJY2 475 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 J3QKU1 62 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 TXNDC9O14530 226 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 FAM155BO75949 473 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 FBLP22087 321 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 MMP11P24347 488 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 STX2P32856 288 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 RRADP55042 308 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 CDKL1Q00532 357 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 DSG2Q14126 1118 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 USP10Q14694 798 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 DCAF10Q5QP82 559 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 ATG14Q6ZNE5 492 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 ASB18Q6ZVZ8 466 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 CTAGE3PQ8IX95 158 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 AMER3Q8N944 861 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 FDCSPQ8NFU4 85 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 ABHD11Q8NFV4 315 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 OR4K1Q8NGD4 311 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 COL26A1Q96A83 441 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 THAP11Q96EK4 314 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 TSPAN17Q96FV3 270 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 P4HTMQ9NXG6 502 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 DOCK10Q96BY6 2186 aa16.87■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 MASP2O00187 686 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 SOCS6O14544 535 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 TUBB4AP04350 444 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 SLC26A3P40879 764 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 SLC12A2P55011 1212 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 NAB1Q13506 487 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 COLEC12Q5KU26 742 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 GRTP1Q5TC63 336 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 PPM1NQ8N819 430 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 STT3BQ8TCJ2 826 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 NEIL2Q969S2 332 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 NACC2Q96BF6 587 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 TM4SF19Q96DZ7 209 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 SARGQ9BW04 601 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 NUDT9Q9BW91 350 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 TRIM4Q9C037 500 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 DRC3Q9H069 523 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 EPN3Q9H201 632 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 SPNS1Q9H2V7 528 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 ANAPC2Q9UJX6 822 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 CDC14AQ9UNH5 594 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 SCN3AQ9NY46 2000 aa16.86■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 I3L1I5 382 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 AGPSO00116 658 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 PEX12O00623 359 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 FFAR3O14843 346 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 GPR42O15529 346 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 ANXA5P08758 320 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 ZGLP1P0C6A0 271 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 CCDC166P0CW27 439 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 STMN1P16949 149 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 SPRP35270 261 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 GMPRP36959 345 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 CASRP41180 1078 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 CCR8P51685 355 aa16.85■□□□□ 0.29
CS-219ENST00000550655 PGDP52209 483 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms