RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	IGHV2-70	P01814	119 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT6B	P04259	564 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SMIM18	P0DKX4	95 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	FUT1	P19526	365 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CYP2F1	P24903	491 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PRDX6	P30041	224 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	GDI1	P31150	447 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	STX2	P32856	288 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	RPL3	P39023	403 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT6C	P48668	564 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	FMO5	P49326	533 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	MMP15	P51511	669 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	P2RX3	P56373	397 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	HUNK	P57058	714 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ST3GAL1	Q11201	340 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	IL24	Q13007	206 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT31	Q15323	416 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	NPTX1	Q15818	432 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	DUSP6	Q16828	381 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP6R3	Q5H9R7	873 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	RGMB	Q6NW40	437 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	DLEU7	Q6UYE1	221 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	MON1B	Q7L1V2	547 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	COMMD2	Q86X83	199 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC63	Q8NA47	563 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM163	Q8TC26	289 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ELP5	Q8TE02	316 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	RNF139	Q8WU17	664 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SEMA4D	Q92854	862 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC51	Q96ER9	411 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	APOLD1	Q96LR9	279 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CFAP53	Q96M91	514 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	QRFPR	Q96P65	431 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	MYADM	Q96S97	322 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CDK19	Q9BWU1	502 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM245	Q9H330	911 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ECT2	Q9H8V3	914 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	DONSON	Q9NYP3	566 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXA2	Q9Y261	457 aa	Predicted RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ADGRL2	O95490	1459 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2M5	A3KFT3	312 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PRSS44	E7EML9	344 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702		J3KR12	359 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC28A1	O00337	649 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	HSPA12A	O43301	675 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ADCY5	O95622	1261 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CXCL10	P02778	98 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SP9	P0CG40	484 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CALCB	P10092	127 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	THRB	P10828	461 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	TNFRSF1B	P20333	461 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	GLRA2	P23416	452 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	JAK1	P23458	1154 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SSTR1	P30872	391 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	PTGER4	P35408	488 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	RASSF2	P50749	326 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SELENOV	P59797	346 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	COG7	P83436	770 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	RUNX1T1	Q06455	604 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC34A1	Q06495	639 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	GPM6B	Q13491	265 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	CUL2	Q13617	745 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	3.75	□□□□□ -1.81	5e-6	■■■■□ 21.2
FAM49B-222	ENST00000522702	EFNB3	Q15768	340 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702		Q5PR19	223 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ELFN2	Q5R3F8	820 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGAP11A	Q6P4F7	1023 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		3.75	□□□□□ -1.81
FAM49B-222	ENST00000522702	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	3.75	□□□□□ -1.81	4e-7	■■■■■ 68.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.3 ms