RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520371.5

CCNC-209, Transcript of cyclin C, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CCNC, Length 2,186 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNC-209ENST00000520371 FAHD1Q6P587 224 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 GAREM2Q75VX8 874 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 PRSS48Q7RTY5 328 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 CAMKMTQ7Z624 323 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 YIPF6Q96EC8 236 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 PITX2Q99697 317 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 DGKBQ9Y6T7 804 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 LEFTY2O00292 366 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 FAM20BO75063 409 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 CYP4B1P13584 511 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 HPCAL1P37235 193 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 BCAP31P51572 246 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 PNLIPRP1P54315 467 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 MLLT10P55197 1068 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 VLDLRP98155 873 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 ATP1A4Q13733 1029 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 SLC22A15Q8IZD6 547 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 CMTM8Q8IZV2 173 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 ITFG2Q969R8 447 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 CFHR5Q9BXR6 569 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 ANKHQ9HCJ1 492 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa15.94■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 WASH3PC4AMC7 463 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 SUV39H1O43463 412 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 LRG1P02750 347 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 HLA-FP30511 346 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 VIPR1P32241 457 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 DOC2AQ14183 400 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 CLCA4Q14CN2 919 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 TRIM16LQ309B1 348 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 SPIN4Q56A73 249 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 FCGR1BQ92637 280 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 GLMNQ92990 594 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 CXorf40BQ96DE9 158 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 GIN1Q9NXP7 522 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 FBXO10Q9UK96 956 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 CATP04040 527 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 NPRL3Q12980 569 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 SYTL3Q4VX76 610 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 LDLRAP1Q5SW96 308 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 CNKSR3Q6P9H4 555 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 VTCN1Q7Z7D3 282 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 HS6ST3Q8IZP7 471 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 TRAM1L1Q8N609 369 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 BBS2Q9BXC9 721 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 PCDH12Q9NPG4 1184 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 AKIP1Q9NQ31 210 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 FBXO8Q9NRD0 319 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 CD84Q9UIB8 345 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 FZD4Q9ULV1 537 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 VPS4AQ9UN37 437 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 PADI2Q9Y2J8 665 aa15.93■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 KIAA1671Q9BY89 1806 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 TEX28O15482 410 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 LAMP1P11279 417 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 CDH3P22223 829 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 NR4A1P22736 598 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 PSMB9P28065 219 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 HOXA9P31269 272 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 PCGF2P35227 344 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 RELAQ04206 551 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 DMC1Q14565 340 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 AGTRAPQ6RW13 159 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 ADCK1Q86TW2 530 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 ZBTB46Q86UZ6 589 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 TMEM159Q96B96 161 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 REPS1Q96D71 796 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 SGK2Q9HBY8 427 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 ACOT13Q9NPJ3 140 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 COL4A6Q14031 1691 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 MT-ND2P03891 347 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 CD22P20273 847 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 CD6P30203 668 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 RPP38P78345 283 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 FADDQ13158 208 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 LAPTM4AQ15012 233 aa15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CCNC-209ENST00000520371 CCDC81Q6ZN84 652 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms