RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517654.5

FAM49B-202, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FAM49B, Length 1,817 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49B-202ENST00000517654 LRIT1Q9P2V4 623 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 BTBD3Q9Y2F9 522 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa15.95■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 EBAG9O00559 213 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 T-ENOLP0DO92 83 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 CMPK1P30085 196 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 DPP6P42658 865 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 CCT8P50990 548 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 NUBP1P53384 320 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 OR1D5P58170 312 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 CYP4F2P78329 520 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 ABATP80404 500 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 CFHR1Q03591 330 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 AP5B1Q2VPB7 878 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 OGFOD2Q6N063 350 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 SPESP1Q6UW49 350 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 ADCK2Q7Z695 626 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 RABEPKQ7Z6M1 372 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 NUDT8Q8WV74 236 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 APOLD1Q96LR9 279 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 SLC38A3Q99624 504 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 PLCD4Q9BRC7 762 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 ARL8BQ9NVJ2 186 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 POMT2Q9UKY4 750 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 ASXL3Q9C0F0 2248 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 CACNA1HO95180 2353 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 LNP1A1A4G5 178 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 C2orf74A8MZ97 194 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 SLC28A1O00337 649 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 B4GAT1O43505 415 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 SH3BP5O60239 455 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 CTSVO60911 334 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 LBPP18428 481 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 GFERP55789 205 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 LAPTM5Q13571 262 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 PAGE2BQ5JRK9 111 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 METTL21CQ5VZV1 264 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 MINDY1Q8N5J2 469 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 EID2Q8N6I1 236 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 MACROD1Q9BQ69 325 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 AIF1LQ9BQI0 150 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 RHBGQ9H310 441 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 RXFP3Q9NSD7 469 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 TMEM184CQ9NVA4 438 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa15.94■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 OR2A25A4D2G3 310 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 UBDO15205 165 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 TNFSF14O43557 240 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 HCRTR1O43613 425 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 CER1O95813 267 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 PROS1P07225 676 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 CAPZBP47756 277 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 SCTRP47872 440 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 RPL38P63173 70 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 SLC5A12Q1EHB4 618 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 PERM1Q5SV97 790 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 FAM91A1Q658Y4 838 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 GUSBP11Q6P575 273 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 OOSP2Q86WS3 158 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 OR9I1Q8NGQ6 314 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 CREB3L4Q8TEY5 395 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 CCT7Q99832 543 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 OR51B5Q9H339 312 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 ACTL8Q9H568 366 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 LRTM1Q9HBL6 345 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 RIC8BQ9NVN3 520 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 SLC12A4Q9UP95 1085 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 GPR45Q9Y5Y3 372 aa15.93■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 TRBC2A0A5B9 178 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 NPIPB8E9PQR5 432 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 SAP18O00422 153 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 RGS14O43566 566 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 OR1F1O43749 312 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 CCDC22O60826 627 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 CBX6O95503 412 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 TGFB1P01137 390 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 GLB1P16278 677 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 PRPH2P23942 346 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 ALDH4A1P30038 563 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 CSF2RBP32927 897 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 KLF10Q13118 480 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 NR1D2Q14995 579 aa15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
FAM49B-202ENST00000517654 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms