RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516056.1

RNU6-518P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 518, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-518P, Length 96 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-518P-201ENST00000516056 JMJD4Q9H9V9 463 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-518P-201ENST00000516056 SIRT7Q9NRC8 400 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-518P-201ENST00000516056 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-518P-201ENST00000516056 SOHLH2Q9NX45 425 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-518P-201ENST00000516056 DPP3Q9NY33 737 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-518P-201ENST00000516056 GAGE2DQ9UEU5 116 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-518P-201ENST00000516056 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-518P-201ENST00000516056 OSGIN1Q9UJX0 560 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-518P-201ENST00000516056 CCPG1Q9ULG6 757 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-518P-201ENST00000516056 SCML2Q9UQR0 700 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-518P-201ENST00000516056 FAM96BQ9Y3D0 163 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-518P-201ENST00000516056 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-518P-201ENST00000516056 PPIAL4AQ9Y536 164 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-518P-201ENST00000516056 TENM4Q6N022 2769 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-518P-201ENST00000516056 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-518P-201ENST00000516056 APCP25054 2843 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 PPIAL4EA0A075B759 164 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 NKX2-6A6NCS4 301 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 ANKRD61A6NGH8 418 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 PPIAL4DF5H284 164 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 SEPT4O43236 478 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 MMP23AO75900 390 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 OR6A2O95222 327 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 TFP02787 698 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 MMP1P03956 469 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 RHOXF2BP0C7M4 288 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 PPIAL4FP0DN26 164 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 HSPA6P17066 643 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 ZP3P21754 424 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 SERPINA4P29622 427 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 TGFBR1P36897 503 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 PSMC4P43686 418 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 ZNF131P52739 623 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 PDX1P52945 283 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 DIO3P55073 304 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 CX3CL1P78423 397 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 PTP4A2Q12974 167 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 DOC2AQ14183 400 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 CRMP1Q14194 572 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 VEPH1Q14D04 833 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 HERC3Q15034 1050 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 TAF5Q15542 800 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 PTPN14Q15678 1187 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 LRRC24Q50LG9 513 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 TTC22Q5TAA0 569 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 OR52W1Q6IF63 320 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 GCNT7Q6ZNI0 430 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 GPAT4Q86UL3 456 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 AACSQ86V21 672 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 ZNF567Q8N184 647 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 SLC37A3Q8NCC5 494 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 PPFIBP2Q8ND30 876 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 ZNF502Q8TBZ5 544 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 STARD8Q92502 1023 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 PEX13Q92968 403 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 MYDGFQ969H8 173 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 SH3KBP1Q96B97 665 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 TIFAQ96CG3 184 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 MTMR8Q96EF0 704 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 AIFM3Q96NN9 605 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 FAM173AQ9BQD7 235 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 HSPB9Q9BQS6 159 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 TM2D3Q9BRN9 247 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 FAM167BQ9BTA0 163 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 C19orf24Q9BVV8 132 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 VN1R1Q9GZP7 353 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 TMEM39BQ9GZU3 492 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 DENND2DQ9H6A0 471 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 SP140LQ9H930 580 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 ARFGAP3Q9NP61 516 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 IL1RAPQ9NPH3 570 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 PIGVQ9NUD9 493 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 TMEM106BQ9NUM4 274 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 SPHK1Q9NYA1 384 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 OR14J1Q9UGF5 321 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 ZNF221Q9UK13 617 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 TNXBP22105 4242 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 GTF3C1Q12789 2109 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 PARD3Q8TEW0 1356 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 SALL1Q9NSC2 1324 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 ELOVL7A1L3X0 281 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 FSD2A1L4K1 749 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 C7orf66A4D0T2 115 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-518P-201ENST00000516056 RNF103O00237 685 aa-0.8□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms