RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-222	ENST00000514552	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	STARD5	Q9NSY2	213 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	AMFR	Q9UKV5	643 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	6.69	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		6.69	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552		A8MVJ9	347 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552		B4DGG1	531 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	AP4M1	O00189	453 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC28A2	O43868	658 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	PRPSAP2	O60256	369 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	RNF8	O76064	485 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	JTB	O76095	146 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	HEXIM1	O94992	359 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	NDST3	O95803	873 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	IVL	P07476	585 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	MYBL1	P10243	752 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	KRT10	P13645	584 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	GM2A	P17900	193 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	ERCC2	P18074	760 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	EGR1	P18146	543 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	PSMA2	P25787	234 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	SERPINB3	P29508	390 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	SERPINB6	P35237	376 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	PCK1	P35558	622 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	RGR	P47804	291 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	CDH6	P55285	790 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	B4GALNT1	Q00973	533 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	OGDH	Q02218	1023 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF235	Q14590	738 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	DPYSL2	Q16555	572 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	STX1A	Q16623	288 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	MANEA	Q5SRI9	462 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	PIM3	Q86V86	326 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	BBS5	Q8N3I7	341 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	NPW	Q8N729	165 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	NUS1	Q96E22	293 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	DTD2	Q96FN9	168 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	MGME1	Q9BQP7	344 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	DDA1	Q9BW61	102 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	ANO10	Q9NW15	660 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	PISD	Q9UG56	409 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	PPIL1	Q9Y3C6	166 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	ANKRD36	A6QL64	1941 aa		6.68	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM170A	A1A519	330 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	FAM234B	A2RU67	622 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552		B4E171	279 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	CASC3	O15234	703 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	PPFIA2	O75334	1257 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	LRCH4	O75427	683 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	CREB1	P16220	341 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	ZNF30	P17039	623 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	MST1	P26927	711 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	TSPAN7	P41732	249 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	PRKCI	P41743	596 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	FASLG	P48023	281 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	LIMK2	P53671	638 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	CDK3	Q00526	305 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	UBXN1	Q04323	297 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	ACOX1	Q15067	660 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	CNGA3	Q16281	694 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	LINC00303	Q3SY05	128 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	BOLA3	Q53S33	107 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	DENND2C	Q68D51	928 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	KCTD16	Q68DU8	428 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	PTCHD4	Q6ZW05	846 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	HEATR4	Q86WZ0	1026 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	NRROS	Q86YC3	692 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		6.67	□□□□□ -1.34
PDE4D-222	ENST00000514552	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		6.67	□□□□□ -1.34

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