RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 CSNK1A1LQ8N752 337 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SNX31Q8N9S9 440 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 GALNT6Q8NCL4 622 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 NEIL2Q969S2 332 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2A5Q96R48 311 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 NT5DC2Q9H857 520 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ADGRE2Q9UHX3 823 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 IKZF3Q9UKT9 509 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SSUH2Q9Y2M2 353 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 KLHL20Q9Y2M5 609 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 HYKKA2RU49 373 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 H0YGG7 62 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 UBXN8O00124 270 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 TAF4O00268 1085 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 DSCR3O14972 297 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 KLK8O60259 260 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 UGDHO60701 494 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CTSVO60911 334 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ALBP02768 609 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SHBGP04278 402 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 MYZAPP0CAP1 466 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PYGBP11216 843 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 TCN2P20062 427 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ITGAXP20702 1163 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 GLRBP48167 497 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 HSPA7P48741 367 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 IRF9Q00978 393 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 RGS1Q08116 209 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PCDH1Q08174 1060 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PWP1Q13610 501 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 FAM53BQ14153 422 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SETDB1Q15047 1291 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 TBCCQ15814 346 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PFKFB4Q16877 469 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ATG9BQ674R7 924 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 MFSD9Q8NBP5 474 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 EXT2Q93063 718 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 MR1Q95460 341 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 VPS50Q96JG6 964 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR78Q96P69 363 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CUTCQ9NTM9 273 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PCMTD2Q9NV79 361 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 NDOR1Q9UHB4 597 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 STK38LQ9Y2H1 464 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 KIF26BQ2KJY2 2108 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ACACAQ13085 2346 aa13.91□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 TPRP12270 2363 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SMIM23A6NLE4 172 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 H3BMH7 237 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 COPEO14579 308 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 HAT1O14929 419 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 TAPBPO15533 448 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ALAS2P22557 587 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 RORAP35398 523 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CASP2P42575 452 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SLCO1A2P46721 670 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PHEXP78562 749 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 IRF8Q02556 426 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 TLE3Q04726 772 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 VAC14Q08AM6 782 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 DEFB110Q30KQ9 67 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 TMPRSS11BQ86T26 416 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ASPGQ86U10 573 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 RDH11Q8TC12 318 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC13A3Q8WWT9 602 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 PMEPA1Q969W9 287 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 FKBP10Q96AY3 582 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 REPS1Q96D71 796 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC45A3Q96JT2 553 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CATSPER2Q96P56 530 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4K3Q96R72 315 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM79Q9BSE2 394 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 XPR1Q9UBH6 696 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 LGALS13Q9UHV8 139 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 ZFP69BQ9UJL9 534 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP2-208ENST00000504294 CHD8Q9HCK8 2581 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-208ENST00000504294 URB1O60287 2271 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-208ENST00000504294 SPEGQ15772 3267 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP2-208ENST00000504294 A0A088AWK7 358 aa13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.8 ms