RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 ORAI1Q96D31 301 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 MTBPQ96DY7 904 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 CHMP6Q96FZ7 201 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 NUDCD1Q96RS6 583 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 FNBP1Q96RU3 617 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 CENPOQ9BU64 300 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM109Q9BVC6 243 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 GANQ9H2C0 597 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 MMP25Q9NPA2 562 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 LTB4R2Q9NPC1 389 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 NOX4Q9NPH5 578 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 BATF3Q9NR55 127 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM114A2Q9NRY5 505 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 CLIC5Q9NZA1 410 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 GCNT4Q9P109 453 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 COPG2Q9UBF2 871 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 OR14J1Q9UGF5 321 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 TINAGQ9UJW2 476 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 DNAJC12Q9UKB3 198 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 TTLL3Q9Y4R7 772 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATAD5Q96QE3 1844 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 SCN5AQ14524 2016 aa4.02□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 MYH7BA7E2Y1 1941 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 ASTN1O14525 1302 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 CEP350Q5VT06 3117 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 A0A1B0GUA9 196 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM150BA6NC51 233 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 GOLGA8IPA6NC78 632 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 GOLGA8JA6NMD2 632 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 M0QZ24 198 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 PDHXO00330 501 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 SOCS6O14544 535 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 P4HA2O15460 535 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 ANP32DO95626 131 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCNE2O96020 404 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 PGK2P07205 417 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 NUDT17P0C025 328 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 H2AFZP0C0S5 128 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRIM49P0CI25 452 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRIM49CP0CI26 452 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 UCHL3P15374 230 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 TNNI1P19237 187 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 RRM1P23921 792 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 ANXA13P27216 316 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 SSTR2P30874 369 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 NNMTP40261 264 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 NRIP1P48552 1158 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCNG1P51959 295 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 FKBP1BP68106 108 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 GTF2BQ00403 316 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 BNC1Q01954 994 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRKCEQ02156 737 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 FOXM1Q08050 763 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRAF2Q12933 501 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 CDC16Q13042 620 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 TFDP1Q14186 410 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLMAPQ14BN4 828 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCL15Q16663 113 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 UGCGQ16739 394 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 ODF2Q5BJF6 829 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 DUPD1Q68J44 220 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 WDR73Q6P4I2 378 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP4.01□□□□□ -1.771e-11■■□□□ 13
TIMMDC1-209ENST00000498399 H2AFVQ71UI9 128 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 ANO5Q75V66 913 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 FOXRED2Q8IWF2 684 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 LRRC34Q8IZ02 419 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 GPD1LQ8N335 351 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCDC63Q8NA47 563 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCDC26Q8TAB7 109 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 ATP8B4Q8TF62 1192 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM216AQ8WUB2 273 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 APBB2Q92870 758 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 CCDC127Q96BQ5 260 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 PGM2Q96G03 612 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM81BQ96LP2 452 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPATA33Q96N06 139 aa4.01□□□□□ -1.77
TIMMDC1-209ENST00000498399 TEX12Q9BXU0 123 aa4.01□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms