RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496892.5

POLR1A-210, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 4

Gene POLR1A, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-210ENST00000496892 AGR3Q8TD06 166 aa13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 AGAP11Q8TF27 550 aa13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 CCT6BQ92526 530 aa13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 MOCOSQ96EN8 888 aa13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 PKP4Q99569 1192 aa13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 CMKLR1Q99788 373 aa13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 MVB12BQ9H7P6 319 aa13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 IPPKQ9H8X2 491 aa13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 WASH6PQ9NQA3 447 aa13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 ACSS2Q9NR19 701 aa13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 DNAJC11Q9NVH1 559 aa13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 TRIM33Q9UPN9 1127 aa13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 RNF215Q9Y6U7 377 aa13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 SDK2Q58EX2 2172 aa13.58□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 LRRC14BA6NHZ5 514 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 PDZK1P1A8MUH7 402 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 VPS4BO75351 444 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 WDR47O94967 919 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 EBLN1P0CF75 366 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 TSPAN8P19075 237 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 CCR10P46092 362 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 SLC6A12P48065 614 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 IDH3AP50213 366 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 IFT88Q13099 833 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 PTCHD3Q3KNS1 767 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 PHF19Q5T6S3 580 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 BORAQ6PGQ7 559 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 AGTRAPQ6RW13 159 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 SPRED1Q7Z699 444 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 SFTPA2Q8IWL1 248 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 SNX31Q8N9S9 440 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 OR5K2Q8NHB8 316 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 ESAMQ96AP7 390 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 PDXPQ96GD0 296 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 TMEM79Q9BSE2 394 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 CCDC28BQ9BUN5 200 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 NTMT1Q9BV86 223 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 GSDMCQ9BYG8 508 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 SPATA7Q9P0W8 599 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 STOX2Q9P2F5 926 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 HEY2Q9UBP5 337 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 KCNK6Q9Y257 313 aa13.57□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 CLEC18AA5D8T8 446 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 GOLGA8OA6NCC3 632 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 ERICH4A6NGS2 130 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 PRR19A6NJB7 356 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 GOLGA8NF8WBI6 632 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 ZNF195O14628 629 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 SLC2A4P14672 509 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 GLB1P16278 677 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 GDF5P43026 501 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 BDKRB1P46663 353 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 POLE2P56282 527 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 FOXK1P85037 733 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 CTBSQ01459 385 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 KCNAB2Q13303 367 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 C16orf72Q14CZ0 275 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 FBXO48Q5FWF7 155 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 SPDYAQ5MJ70 313 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 KANK2Q63ZY3 851 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 OGFOD3Q6PK18 319 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 C6orf89Q6UWU4 347 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 CLEC18BQ6UXF7 455 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 CCDC121Q6ZUS5 278 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 CLEC18CQ8NCF0 446 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 OR56A3Q8NH54 315 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 CEP70Q8NHQ1 597 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 C12orf66Q96MD2 445 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 FERD3LQ96RJ6 166 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 MIPEPQ99797 713 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 TUBB6Q9BUF5 446 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 PCBD2Q9H0N5 130 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 SEMA6CQ9H3T2 930 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 ZBTB26Q9HCK0 441 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 GPRC5BQ9NZH0 403 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 PSMD13Q9UNM6 376 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa13.56□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 OR5K4A6NMS3 321 aa13.55□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 STMND1H3BQB6 276 aa13.55□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 CLGNO14967 610 aa13.55□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 UGDHO60701 494 aa13.55□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 CLDN9O95484 217 aa13.55□□□□□ -0.24
POLR1A-210ENST00000496892 SLC16A8O95907 504 aa13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms