RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495188.2

RNF146-208, Transcript of ring finger protein 146, human

TSL 2

Gene RNF146, Length 593 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF146-208	ENST00000495188	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	IQUB	Q8NA54	791 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	SEPT1	Q8WYJ6	367 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	BTBD9	Q96Q07	612 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
RNF146-208	ENST00000495188	IL16	Q14005	1332 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	TRBV4-1	A0A0J9YWV2	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	SERPING1	P05155	500 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	EPOR	P19235	508 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	PSMA3	P25788	255 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	SOX3	P41225	446 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	MTCP1	P56278	107 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	TMEM50B	P56557	158 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	CALCOCO2	Q13137	446 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	MTF1	Q14872	753 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	RBBP7	Q16576	425 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	CES4A	Q5XG92	561 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	CHMP1B	Q7LBR1	199 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	AMIGO1	Q86WK6	493 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	KIF18A	Q8NI77	898 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	ANKRD9	Q96BM1	317 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	PYCR2	Q96C36	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	FAM129A	Q9BZQ8	928 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	SNX25	Q9H3E2	840 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	THEG	Q9P2T0	379 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	IDH3B	O43837	385 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	ALDH1B1	P30837	517 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	SFTPD	P35247	375 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	DCDC1	P59894	354 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	IRX4	P78413	519 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	CACNG1	Q06432	222 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF273	Q14593	569 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	FRRS1	Q6ZNA5	592 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	GPC2	Q8N158	579 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	PRSS33	Q8NF86	280 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	ERP27	Q96DN0	273 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	BAG1	Q99933	345 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	LRRC61	Q9BV99	259 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	RNF121	Q9H920	327 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	PFDN4	Q9NQP4	134 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	NDE1	Q9NXR1	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	SNX7	Q9UNH6	387 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	PCNX3	Q9H6A9	2034 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188		A0A1W2PPW3	197 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	C17orf105	B2RV13	164 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	SOCS3	O14543	225 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	CEACAM4	O75871	244 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	STAG3L1	P0CL83	205 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	PTAFR	P25105	342 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	NFATC2	Q13469	925 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	ZER1	Q7Z7L7	766 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	LRTM2	Q8N967	370 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	NDN	Q99608	321 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	PKD2L2	Q9NZM6	624 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	IL36A	Q9UHA7	158 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	ANXA2P2	A6NMY6	339 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	APOA4	P06727	396 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	AADAC	P22760	399 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	RGS7	P49802	495 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	KRTAP10-5	P60370	271 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	UGCG	Q16739	394 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	FGD3	Q5JSP0	725 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RNF146-208	ENST00000495188	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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