RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490478.5

CACNA2D3-210, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CACNA2D3, Length 3,557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3-210ENST00000490478 CMAHPQ9Y471 501 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC28A1O00337 649 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PDCD5O14737 125 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PROM1O43490 865 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC43A1O75387 559 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PSMD10O75832 226 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RGS11O94810 467 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ANXA6P08133 673 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CD63P08962 238 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CXCL3P19876 107 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 HOXA6P31267 233 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 BAG6P46379 1132 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ALDH9A1P49189 494 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DAPP51397 102 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CASP6P55212 293 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PROX2Q3B8N5 592 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PYDC2Q56P42 97 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MACC1Q6ZN28 852 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ATCAYQ86WG3 371 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CEP97Q8IW35 865 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ENTHD1Q8IYW4 607 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 BVESQ8NE79 360 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SLC13A3Q8WWT9 602 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TFAP2BQ92481 460 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 EXOC2Q96KP1 924 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TEKT3Q9BXF9 490 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NUP98P52948 1817 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TMEM150BA6NC51 233 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FABP12A6NFH5 140 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ERVV-1B6SEH8 477 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 QSOX1O00391 747 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SCAMP1O15126 338 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SYPP08247 313 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ADRA2AP08913 450 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MLNP12872 115 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PRF1P14222 555 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 LHCGRP22888 699 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 HOXA9P31269 272 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SREBF1P36956 1147 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 STARP49675 285 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 RIDAP52758 137 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CAMK1Q14012 370 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 KEAP1Q14145 624 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TRAM2Q15035 370 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TEAD4Q15561 434 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TSC22D1Q15714 1073 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TCTE1Q5JU00 501 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 JADE1Q6IE81 842 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MFSD6LQ8IWD5 586 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 BMPERQ8N8U9 685 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 LRRC46Q96FV0 321 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 C10orf90Q96M02 699 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 COQ10AQ96MF6 247 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM213AQ9BRX8 229 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 CRB3Q9BUF7 120 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ASPNQ9BXN1 380 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 BTBD1Q9H0C5 482 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 GPR160Q9UJ42 338 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 HCN1O60741 890 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 OAZ2O95190 189 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 LY86O95711 162 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 NMBP08949 121 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SMIM6P0DI80 62 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 HLA-EP13747 358 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 PBX3P40426 434 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 DIO3P55073 304 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MTPNP58546 118 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 EMX2Q04743 252 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 SPP2Q13103 211 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 KLHL22Q53GT1 634 aa6.68□□□□□ -1.34
CACNA2D3-210ENST00000490478 FAM74A1Q5RGS3 127 aa6.68□□□□□ -1.34
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