RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ANKRD49Q8WVL7 239 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MVB12AQ96EY5 273 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DYRK1BQ9Y463 629 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCM1Q15154 2024 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ONECUT2O95948 504 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NPPBP16860 134 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCL11P51671 97 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATP6V0D1P61421 351 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CSNK1G2P78368 415 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDKL1Q00532 357 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CHAF1BQ13112 559 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATP1A4Q13733 1029 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CSHL1Q14406 222 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CPZQ66K79 652 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MRGPREQ86SM8 312 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C10orf90Q96M02 699 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CYTH2Q99418 400 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 YIPF2Q9BWQ6 316 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DRC3Q9H069 523 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC22A11Q9NSA0 550 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IKZF3Q9UKT9 509 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM155BO75949 473 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNAJB5O75953 348 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CRABP2P29373 138 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NKG7Q16617 165 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPSM1Q86YR5 675 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLEC1AQ8NC01 280 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CAMKVQ8NCB2 501 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC5A11Q8WWX8 675 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 VPS50Q96JG6 964 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC26A1Q9H2B4 701 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CTSFQ9UBX1 484 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SH2B3Q9UQQ2 575 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNE2Q9Y6J6 123 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF462Q96JM2 2506 aa18.83■□□□□ 0.61
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FEZF1A0PJY2 475 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C1QAP02745 245 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 S100BP04271 92 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC35G6P0C7Q6 338 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AVPR1BP47901 424 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DSG2Q14126 1118 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 COX15Q7KZN9 410 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TCAIMQ8N3R3 496 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SPATA6LQ8N4H0 392 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ABHD11Q8NFV4 315 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NACC2Q96BF6 587 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MIEF2Q96C03 454 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TSNARE1Q96NA8 513 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC25A23Q9BV35 468 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIM55Q9BYV6 548 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NINJ2Q9NZG7 142 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRPC4Q9UBN4 977 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IKBKGQ9Y6K9 419 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 P2RX6O15547 441 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC28A2O43868 658 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MED26O95402 600 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ACSL3O95573 720 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STATHP02808 62 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PGDP52209 483 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FAM53BQ14153 422 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TGFBIQ15582 683 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TCTN3Q6NUS6 607 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ASPGQ86U10 573 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RELL1Q8IUW5 271 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IFT20Q8IY31 132 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DTWD1Q8N5C7 304 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC13A3Q8WWT9 602 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR4K3Q96R72 315 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CRB3Q9BUF7 120 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WWOXQ9NZC7 414 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RNF112Q9ULX5 631 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC22A14Q9Y267 594 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXB-AS3-204ENST00000466037 A6NL46 340 aa18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms