RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 OR8J2Q8NGG1 315 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 YME1L1Q96TA2 773 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 LINC00597Q9H2U6 94 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 MTG2Q9H4K7 406 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 ENPP5Q9UJA9 477 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa16.37■□□□□ 0.21
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ACTB-207ENST00000462494 PRMT3O60678 531 aa16.37■□□□□ 0.21
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ACTB-207ENST00000462494 FGF18O76093 207 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 TYRP14679 529 aa16.37■□□□□ 0.21
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ACTB-207ENST00000462494 WEE1P30291 646 aa16.37■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 PSMD7P51665 324 aa16.37■□□□□ 0.21
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ACTB-207ENST00000462494 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
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ACTB-207ENST00000462494 MAL2Q969L2 176 aa16.37■□□□□ 0.21
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ACTB-207ENST00000462494 GABRR3A8MPY1 467 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 FKTNO75072 461 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 AP2A2O94973 939 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 PCSK2P16519 638 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 XPAP23025 273 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
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ACTB-207ENST00000462494 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
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ACTB-207ENST00000462494 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa16.36■□□□□ 0.21
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ACTB-207ENST00000462494 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
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ACTB-207ENST00000462494 OR4K3Q96R72 315 aa16.36■□□□□ 0.21
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ACTB-207ENST00000462494 RASSF1Q9NS23 344 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 TMEM39AQ9NV64 488 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 SCN3BQ9NY72 215 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 TPRKBQ9Y3C4 175 aa16.36■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 CXCL14O95715 111 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 SLC16A8O95907 504 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 CASP9P55211 416 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 KEAP1Q14145 624 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 ZNF284Q2VY69 593 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 TMEM215Q68D42 235 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 LAIR1Q6GTX8 287 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 GRHL2Q6ISB3 625 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 CCDC149Q6ZUS6 474 aa16.35■□□□□ 0.21
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ACTB-207ENST00000462494 ZNF540Q8NDQ6 660 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 ABHD11Q8NFV4 315 aa16.35■□□□□ 0.21
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ACTB-207ENST00000462494 TBC1D20Q96BZ9 403 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 APOL4Q9BPW4 351 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 ZBP1Q9H171 429 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 SH3BP4Q9P0V3 963 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 KIAA1671Q9BY89 1806 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa16.35■□□□□ 0.21
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ACTB-207ENST00000462494 SEMG1P04279 462 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 TIMP2P16035 220 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 RAE1P78406 368 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 ITGADQ13349 1161 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 DGCR6Q14129 220 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 CTF1Q16619 201 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 PGBD3Q8N328 593 aa16.35■□□□□ 0.21
ACTB-207ENST00000462494 TRAM1L1Q8N609 369 aa16.35■□□□□ 0.21
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