RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 ASB18Q6ZVZ8 466 aa22.84■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.84■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 PPM1NQ8N819 430 aa22.84■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa22.84■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 J3QKU1 62 aa22.83■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 P2RX6O15547 441 aa22.83■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 C1QAP02745 245 aa22.83■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 FBLP22087 321 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
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SMKR1-201ENST00000462322 OCA2Q04671 838 aa22.83■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 PPP1R3AQ16821 1122 aa22.83■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa22.83■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa22.83■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa22.83■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 FBF1Q8TES7 1133 aa22.83■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 MVB12AQ96EY5 273 aa22.83■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 SPSB2Q99619 263 aa22.83■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 GPR22Q99680 433 aa22.83■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SMKR1-201ENST00000462322 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa22.83■■□□□ 1.25
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SMKR1-201ENST00000462322 STATHP02808 62 aa22.82■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 CTAGE8P0CG41 777 aa22.82■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 SPRP35270 261 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 PGDP52209 483 aa22.82■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 GRTP1Q5TC63 336 aa22.82■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 FRA10AC1Q70Z53 315 aa22.82■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa22.82■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 CTAGE6Q86UF2 777 aa22.82■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 CTAGE4Q8IX94 777 aa22.82■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 THAP11Q96EK4 314 aa22.82■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa22.82■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 EGFL8Q99944 293 aa22.82■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 ANAPC2Q9UJX6 822 aa22.82■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 VSTM2BA6NLU5 285 aa22.81■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 ANXA5P08758 320 aa22.81■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 MMP11P24347 488 aa22.81■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 CCR8P51685 355 aa22.81■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 OARD1Q9Y530 152 aa22.81■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 I3L1I5 382 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 CEACAM4O75871 244 aa22.8■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 FAM155BO75949 473 aa22.8■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 CCDC166P0CW27 439 aa22.8■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 BCL6P41182 706 aa22.8■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 CDKL1Q00532 357 aa22.8■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 KLRB1Q12918 225 aa22.8■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 NAB1Q13506 487 aa22.8■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 DSG2Q14126 1118 aa22.8■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 DCAF10Q5QP82 559 aa22.8■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 SPATA6LQ8N4H0 392 aa22.8■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa22.8■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 TEX19Q8NA77 164 aa22.8■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 ABHD11Q8NFV4 315 aa22.8■■□□□ 1.24
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SMKR1-201ENST00000462322 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 ZGLP1P0C6A0 271 aa22.79■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 KLC1Q07866 573 aa22.79■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 FAM53BQ14153 422 aa22.79■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 CSHL1Q14406 222 aa22.79■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 RBBP7Q16576 425 aa22.79■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
SMKR1-201ENST00000462322 CAMKVQ8NCB2 501 aa22.79■■□□□ 1.24
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