RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 FFAR4Q5NUL3 377 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 NT5DC1Q5TFE4 455 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ATF7IP2Q5U623 682 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 YOD1Q5VVQ6 348 aaPredicted RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 FAM205BPQ63HN1 556 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 OLFML2AQ68BL7 652 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 DENND2CQ68D51 928 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 KCTD11Q693B1 232 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF470Q6ECI4 717 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ACSM5Q6NUN0 579 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 TAF2Q6P1X5 1199 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CEP85Q6P2H3 762 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CTR9Q6PD62 1173 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ACP7Q6ZNF0 438 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF621Q6ZSS3 439 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 Q6ZWC4 215 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 C16orf62Q7Z3J2 963 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF554Q86TJ5 538 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 P2RY8Q86VZ1 359 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 VPS37DQ86XT2 251 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GLYCTKQ8IVS8 523 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 VSTM4Q8IW00 320 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PRSS58Q8IYP2 241 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PM20D2Q8IYS1 436 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 POC5Q8NA72 575 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 BHLHE23Q8NDY6 225 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 OR51T1Q8NGJ9 327 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 OR1B1Q8NGR6 318 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SLC35B2Q8TB61 432 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SPPL2BQ8TCT7 592 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 DCAF11Q8TEB1 546 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 RNF139Q8WU17 664 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GTSF1Q8WW33 167 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GLMPQ8WWB7 406 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 KCNJ9Q92806 393 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 KCNB2Q92953 911 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MR1Q95460 341 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SMARCE1Q969G3 411 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MARC2Q969Z3 335 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 RNF185Q96GF1 192 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MYO19Q96H55 970 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 FEM1CQ96JP0 617 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 C8orf48Q96LL4 319 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ZNF597Q96LX8 424 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PWWP2AQ96N64 755 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 DUX5Q96PT3 197 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 NEK1Q96PY6 1258 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 DOK1Q99704 481 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 TIMM29Q9BSF4 260 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 TBCDQ9BTW9 1192 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 TRIM2Q9C040 744 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SIRPDQ9H106 197 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CENPHQ9H3R5 247 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CYP4F11Q9HBI6 524 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ZFP14Q9HCL3 533 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CISHQ9NSE2 258 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 RDH8Q9NYR8 311 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 UVRAGQ9P2Y5 699 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 DNAJB11Q9UBS4 358 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 NDRG3Q9UGV2 375 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PHF11Q9UIL8 331 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ANAPC7Q9UJX3 599 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ANAPC2Q9UJX6 822 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 APPL1Q9UKG1 709 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 OGDHLQ9ULD0 1010 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 TPCN1Q9ULQ1 816 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 COQ6Q9Y2Z9 468 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 NFS1Q9Y697 457 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 CPDO75976 1380 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SCRIBQ14160 1630 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa-2.14□□□□□ -2.75
SNORD54-201ENST00000459159 IFT172Q9UG01 1749 aa-2.14□□□□□ -2.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms