RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450873.6

RABGEF1-205, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 2,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNAB1Q14722 419 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 DCAF12Q5T6F0 453 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 FCRL6Q6DN72 434 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAJC22Q8N4W6 341 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 OR8K5Q8NH50 307 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 UBTD2Q8WUN7 234 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 WBP1Q96G27 269 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 OR4K3Q96R72 315 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 OR6C1Q96RD1 312 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ZPBPQ9BS86 351 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM79Q9BSE2 394 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 DDA1Q9BW61 102 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 CD244Q9BZW8 370 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC6A20Q9NP91 592 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 RARRES3Q9UL19 164 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 GRID1Q9ULK0 1009 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PLCL2Q9UPR0 1127 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC22A14Q9Y267 594 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 KLHL20Q9Y2M5 609 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 KCNE2Q9Y6J6 123 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PMS2P1A4D2B8 440 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 OR2A25A4D2G3 310 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAMEF10O60809 474 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 TAC1P20366 129 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 HSPA7P48741 367 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ATP1A2P50993 1020 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 RELAQ04206 551 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 TUBB3Q13509 450 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SETDB1Q15047 1291 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PFKFB4Q16877 469 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ZNF425Q6IV72 752 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 TLDC1Q6P9B6 456 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 CEACAM20Q6UY09 585 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 C4orf33Q8N1A6 199 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 USP7Q93009 1102 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 FCRL4Q96PJ5 515 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 FAM60AQ9NP50 221 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 FGF21Q9NSA1 209 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 DNAJC11Q9NVH1 559 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SERTAD3Q9UJW9 196 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 KIF26BQ2KJY2 2108 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 H7BY64 318 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 NVLO15381 856 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 MYZAPP0CAP1 466 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 FGF5P12034 268 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 GDF5P43026 501 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 RPS6KA3P51812 740 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 YBX1P67809 324 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 GUCY1A3Q02108 690 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 GPR19Q15760 415 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 CCDC153Q494R4 210 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 C16orf46Q6P387 395 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PCSK4Q6UW60 755 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ADCK2Q7Z695 626 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PAQR7Q86WK9 346 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PPP1R3BQ86XI6 285 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 TMEM151AQ8N4L1 468 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 ABHD11Q8NFV4 315 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SLC5A11Q8WWX8 675 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PGM2Q96G03 612 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PRAP1Q96NZ9 151 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SMC6Q96SB8 1091 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 CENPHQ9H3R5 247 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 MKS1Q9NXB0 559 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 GPRC5BQ9NZH0 403 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 GOLGA6L10A6NI86 522 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 CDRT15L2A8MXV6 281 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 STX16O14662 325 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 KLK10O43240 276 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 CDH1P12830 882 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 GNAZP19086 355 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 GABRA4P48169 554 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 CCR8P51685 355 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 CDC16Q13042 620 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 IFT88Q13099 833 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 BANPQ8N9N5 519 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGEF1-205ENST00000450873 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.8 ms