RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	CXCR2	P25025	360 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	GSTM2	P28161	218 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	DLST	P36957	453 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	DCD	P81605	110 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	PCDH1	Q08174	1060 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	DNASE1L3	Q13609	305 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	MUM1	Q2TAK8	710 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	VASH2	Q86V25	355 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	OR4N4	Q8N0Y3	316 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	MREG	Q8N565	214 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	MR1	Q95460	341 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	NEIL2	Q969S2	332 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	FKBP10	Q96AY3	582 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	CATSPER2	Q96P56	530 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	VPS11	Q9H270	941 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	CUTC	Q9NTM9	273 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		13.98	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	LAMA5	O15230	3695 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	HYKK	A2RU49	373 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	TAPBP	O15533	448 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	CDH16	O75309	829 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	SUPT3H	O75486	399 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	WDR47	O94967	919 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	ALB	P02768	609 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	ITGB2	P05107	769 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	MTHFD2	P13995	350 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	PTPN4	P29074	926 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	AHR	P35869	848 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	HSD17B3	P37058	310 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	KCNC1	P48547	511 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	CXADR	P78310	365 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	IRF9	Q00978	393 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	RHD	Q02161	417 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	CDC16	Q13042	620 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	FAM53B	Q14153	422 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFA9	Q16795	377 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	PRAMEF17	Q5VTA0	474 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	ATG9B	Q674R7	924 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	TTL	Q8NG68	377 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	CT55	Q8WUE5	264 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	MRPL57	Q9BQC6	102 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	AIF1L	Q9BQI0	150 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	CD244	Q9BZW8	370 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	CHST8	Q9H2A9	424 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	CPNE5	Q9HCH3	593 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	COPG2	Q9UBF2	871 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	PADI2	Q9Y2J8	665 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	CACNA1G	O43497	2377 aa		13.97	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	MAP2K7	O14733	419 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	NRP2	O60462	931 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	RFPL1	O75677	317 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	GSTA1	P08263	222 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	PIK3CG	P48736	1102 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	REEP5	Q00765	189 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	PWP1	Q13610	501 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	E2F2	Q14209	437 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	SETDB1	Q15047	1291 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	NCF4	Q15080	339 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	TBCC	Q15814	346 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	PDK4	Q16654	411 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	FAM198B	Q6UWH4	519 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	SYVN1	Q86TM6	617 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	MZB1	Q8WU39	189 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	STARD8	Q92502	1023 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	NACC2	Q96BF6	587 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	WDR34	Q96EX3	536 aa		13.96	□□□□□ -0.17
PTPA-222	ENST00000445241	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		13.96	□□□□□ -0.17

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