RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 ACSS2Q9NR19 701 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM184CQ9NVA4 438 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 TLK1Q9UKI8 766 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 IKZF3Q9UKT9 509 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa13.49□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 NUP210LQ5VU65 1888 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 TXNDC9O14530 226 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 UMODP07911 640 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 STX2P32856 288 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 OR1D4P47884 311 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CSNK1G2P78368 415 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 GUCY2DQ02846 1103 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ATP1A4Q13733 1029 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP1R3AQ16821 1122 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 HKDC1Q2TB90 917 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 GARNL3Q5VVW2 1013 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 TCTN3Q6NUS6 607 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 LCTLQ6UWM7 567 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 MED25Q71SY5 747 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PLD3Q8IV08 490 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CTAGE3PQ8IX95 158 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 MMGT1Q8N4V1 131 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 DTWD1Q8N5C7 304 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 MVB12AQ96EY5 273 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 TSPAN17Q96FV3 270 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 GPAMQ9HCL2 828 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF304Q9HCX3 659 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CTSFQ9UBX1 484 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 SH2B3Q9UQQ2 575 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 MAU2Q9Y6X3 613 aa13.48□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CDC7O00311 574 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 GUCA1CO95843 209 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 NPPBP16860 134 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CASRP41180 1078 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 RRADP55042 308 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 FOXL2P58012 376 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 NAB1Q13506 487 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 USP10Q14694 798 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 NKG7Q16617 165 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 C4orf17Q53FE4 359 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PPM1NQ8N819 430 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 FBF1Q8TES7 1133 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD49Q8WVL7 239 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 NACC2Q96BF6 587 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PYCR2Q96C36 320 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 THAP11Q96EK4 314 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 SPSB2Q99619 263 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM129AQ9BZQ8 928 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 DERL2Q9GZP9 239 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CAB39LQ9H9S4 337 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CDC14AQ9UNH5 594 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PLAAQ9Y263 795 aa13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ICE1Q9Y2F5 2266 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 BLACEA4D250 179 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CTAGE15A4D2H0 777 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 VSTM2BA6NLU5 285 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PEX12O00623 359 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 P2RX6O15547 441 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP13.46□□□□□ -0.252e-6■■■□□ 14.6
SH3BP4-205ENST00000444916 CEACAM4O75871 244 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 IGHEP01854 428 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CTAGE8P0CG41 777 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CDH1P12830 882 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 STMN1P16949 149 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 FBLP22087 321 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 MMP11P24347 488 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 GRK3P35626 688 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CCL11P51671 97 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CDKL1Q00532 357 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 GRTP1Q5TC63 336 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 FRA10AC1Q70Z53 315 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 VN1R4Q7Z5H5 301 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CTAGE6Q86UF2 777 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 TMEM151BQ8IW70 566 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 CTAGE4Q8IX94 777 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 ABHD11Q8NFV4 315 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 KIF18AQ8NI77 898 aa13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
SH3BP4-205ENST00000444916 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms