RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM114A2Q9NRY5 505 aa12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BFARQ9NZS9 450 aa12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCHS2Q6V1P9 2916 aa12.47□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF839A8K0R7 811 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC19A2O60779 497 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ESR1P03372 595 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CATP04040 527 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPL22P35268 128 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AVPR1BP47901 424 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF75DP51815 510 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PNLIPRP1P54315 467 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CASP6P55212 293 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADARP55265 1226 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADORA2A-AS1P86434 159 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNX1Q13596 522 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL38Q2WGJ6 581 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACSBG2Q5FVE4 666 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF766Q5HY98 468 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 XKRXQ6PP77 449 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ADCK2Q7Z695 626 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPFIBP2Q8ND30 876 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 METTL21AQ8WXB1 218 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MFSD3Q96ES6 412 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PKP4Q99569 1192 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM8Q9BZR9 551 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STMN3Q9NZ72 180 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2CD3Q4AC94 2353 aa12.46□□□□□ -0.41
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCN2AQ99250 2005 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA8KD6RF30 607 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GOLGA8TH3BQL2 631 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AP3B1O00203 1094 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HAT1O14929 419 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PFDN6O15212 129 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VAPBO95292 243 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CYC1P08574 325 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHRM3P20309 590 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MGAT1P26572 445 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HSD17B2P37059 387 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NPY2RP49146 381 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABATP80404 500 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BASP1P80723 227 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RELAQ04206 551 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCNJ11Q14654 390 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C3AR1Q16581 482 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFA9Q16795 377 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CES3Q6UWW8 571 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LANCL3Q6ZV70 420 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLD3Q8IV08 490 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF480Q8WV37 535 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DESI2Q9BSY9 194 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIFC1Q9BW19 673 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VN1R1Q9GZP7 353 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYBUQ9NX95 663 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GALPQ9UBC7 116 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TINAGQ9UJW2 476 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRYL1Q9Y2S2 319 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa12.46□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLQO75417 2590 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A8MUI8 341 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E5RI56 91 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 E7ENX8 843 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H0YIG0 161 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMAPO00193 183 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC16A8O95907 504 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OGNP20774 298 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AGAP20933 346 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TAP2Q03519 686 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BTBD16Q32M84 506 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MINDY4Q4G0A6 757 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MFSD4BQ5TF39 518 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PLAG1Q6DJT9 500 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BEST3Q8N1M1 668 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR9A4Q8NGU2 314 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MAGED4Q96JG8 741 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF354BQ96LW1 612 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR137Q96N19 417 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCF12Q99081 682 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABCF3Q9NUQ8 709 aa12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCNX1Q96RV3 2341 aa12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TACC2O95359 2948 aa12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTI1O43156 1089 aa12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WISP2O76076 250 aa12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NSA2O95478 260 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 STATHP02808 62 aa12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMSP52788 366 aa12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TUBA3CQ13748 450 aa12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACER2Q5QJU3 275 aa12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCRLBQ6BAA4 426 aa12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KIAA0930Q6ICG6 404 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3F3CQ6NXT2 135 aa12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.2 ms