RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 BBS9Q3SYG4 887 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 MSS51Q4VC12 460 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 C4orf17Q53FE4 359 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 ATG9BQ674R7 924 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 IGFL2Q6UWQ7 119 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 ISLR2Q6UXK2 745 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 SHISA5Q8N114 240 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 SIRT6Q8N6T7 355 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 CATSPER1Q8NEC5 780 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 MVB12AQ96EY5 273 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 ATG10Q9H0Y0 220 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 C14orf105Q9NVL8 296 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 SVILO95425 2214 aa14.76□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 LRRK2Q5S007 2527 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 F10P00742 488 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 CXCR2P25025 360 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 GABRB3P28472 473 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 EFNA3P52797 238 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PGGT1BP53609 377 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 MFAP5Q13361 173 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 MFSD4BQ5TF39 518 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 GARNL3Q5VVW2 1013 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PAQR3Q6TCH7 311 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 NDUFAF7Q7L592 441 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PRSS41Q7RTY9 318 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 KBTBD2Q8IY47 623 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 OR9A4Q8NGU2 314 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 LINGO1Q96FE5 620 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 CFAP36Q96G28 342 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PWWP2AQ96N64 755 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 KCNF1Q9H3M0 494 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PLA2G3Q9NZ20 509 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PDE10AQ9Y233 779 aa14.75□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 FEZF1A0PJY2 475 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 TXNDC9O14530 226 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 JRKO75564 520 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PRR35P0CG20 571 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 IL1RNP18510 177 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 TSFMP43897 325 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 AVPR1BP47901 424 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 RGS4P49798 205 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 CDKN2DP55273 166 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 ARG2P78540 354 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 NDUFA9Q16795 377 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 MCOLN3Q8TDD5 553 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 GRHL3Q8TE85 626 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 CERS2Q96G23 380 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 CCDC138Q96M89 665 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 TAS2R13Q9NYV9 303 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 MKL2Q9ULH7 1088 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.74□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 NAV2Q8IVL1 2488 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 E2F3O00716 465 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 ZSCAN12O43309 604 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 C8GP07360 202 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 CSNK1G2P78368 415 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 NAE1Q13564 534 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PCOLCEQ15113 449 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 TLR1Q15399 786 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PHKG1Q16816 387 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 AGTRAPQ6RW13 159 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 PALM2Q8IXS6 379 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 GPATCH11Q8N954 259 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 RIC8BQ9NVN3 520 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 HCN3Q9P1Z3 774 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.73□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 USP27XA6NNY8 438 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 CES2O00748 559 aa14.72□□□□□ -0.05
ACTB-202ENST00000414620 TTC4O95801 387 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms