RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414069.2

SPRN-201, Transcript of shadow of prion protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRN, Length 3,128 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRN-201ENST00000414069 RAP2AP10114 183 aa20.14■□□□□ 0.82
SPRN-201ENST00000414069 MYF6P23409 242 aa20.14■□□□□ 0.82
SPRN-201ENST00000414069 PON2Q15165 354 aa20.14■□□□□ 0.82
SPRN-201ENST00000414069 MEP1AQ16819 746 aa20.14■□□□□ 0.82
SPRN-201ENST00000414069 CCDC149Q6ZUS6 474 aa20.14■□□□□ 0.82
SPRN-201ENST00000414069 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
SPRN-201ENST00000414069 VTCN1Q7Z7D3 282 aa20.14■□□□□ 0.82
SPRN-201ENST00000414069 C12orf40Q86WS4 652 aa20.14■□□□□ 0.82
SPRN-201ENST00000414069 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.14■□□□□ 0.82
SPRN-201ENST00000414069 BTBD3Q9Y2F9 522 aa20.14■□□□□ 0.82
SPRN-201ENST00000414069 CLDN25C9JDP6 229 aa20.14■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 ETHE1O95571 254 aa20.14■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 FRG2Q64ET8 278 aa20.14■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa20.14■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 PRR23CQ6ZRP0 262 aa20.14■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 BPIFB1Q8TDL5 484 aa20.14■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 ZFP90Q8TF47 636 aa20.14■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 FRG2BQ96QU4 278 aa20.14■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 CCDC90BQ9GZT6 254 aa20.14■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 RAD21L1Q9H4I0 556 aa20.14■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 DNAJC11Q9NVH1 559 aa20.14■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 TRPS1Q9UHF7 1281 aa20.14■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 ERVW-1Q9UQF0 538 aa20.14■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 BOLA1Q9Y3E2 137 aa20.14■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 TRANK1O15050 2925 aa20.14■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 ARNTLO00327 626 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 MOSPD3O75425 235 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 CREG1O75629 220 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 PPM1AP35813 382 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 TCEA2Q15560 299 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 PAGE2BQ5JRK9 111 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 TMEM220Q6QAJ8 160 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 TRIM46Q7Z4K8 759 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 USP7Q93009 1102 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 SLC12A9Q9BXP2 914 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 SNX6Q9UNH7 406 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 NUMA1Q14980 2115 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 XYLBO75191 536 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 MFN2O95140 757 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 PFKLP17858 780 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 CYP2A7P20853 494 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 AGXTP21549 392 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 BMPR1AP36894 532 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 SEPHS1P49903 392 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 PFN3P60673 137 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 CYP27C1Q4G0S4 372 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 RIMKLAQ8IXN7 391 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 MAL2Q969L2 176 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 TMEM159Q96B96 161 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 SDCCAG3Q96C92 435 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 LMLNQ96KR4 655 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 TOX2Q96NM4 488 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 CSF3RQ99062 836 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 IL6P05231 212 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 NUDT7P0C024 238 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 ELFN1P0C7U0 828 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 COX7A2P14406 83 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 TIMP2P16035 220 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 RACK1P63244 317 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 SPCS2Q15005 226 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 HKDC1Q2TB90 917 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 MPP7Q5T2T1 576 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 NOXRED1Q6NXP6 359 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 SH3KBP1Q96B97 665 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 AP2M1Q96CW1 435 aa20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 H0Y858 1186 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 AGRPO00253 132 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 YY2O15391 372 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 SYTL1Q8IYJ3 562 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 CFHR5Q9BXR6 569 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 TRIM39Q9HCM9 518 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 SERHLQ9NQF3 203 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 PLAGL1Q9UM63 463 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 MAGEB17A8MXT2 336 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 SGTAO43765 313 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 THRBP10828 461 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 NNMTP40261 264 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 DOC2AQ14183 400 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 TMPRSS11BQ86T26 416 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 AKAP14Q86UN6 197 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 MICU2Q8IYU8 434 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 TPD52L3Q96J77 140 aa20.12■□□□□ 0.81
SPRN-201ENST00000414069 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms